Protein–RNA interactions for Protein: A2A654

Bptf, Bromodomain PHD finger transcription factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BptfA2A654 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BptfA2A654 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BptfA2A654 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BptfA2A654 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BptfA2A654 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BptfA2A654 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BptfA2A654 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BptfA2A654 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BptfA2A654 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BptfA2A654 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BptfA2A654 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BptfA2A654 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BptfA2A654 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BptfA2A654 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BptfA2A654 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BptfA2A654 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BptfA2A654 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BptfA2A654 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BptfA2A654 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BptfA2A654 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BptfA2A654 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BptfA2A654 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BptfA2A654 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
BptfA2A654 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
BptfA2A654 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BptfA2A654 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BptfA2A654 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BptfA2A654 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BptfA2A654 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BptfA2A654 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BptfA2A654 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BptfA2A654 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BptfA2A654 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BptfA2A654 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BptfA2A654 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BptfA2A654 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BptfA2A654 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BptfA2A654 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BptfA2A654 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BptfA2A654 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BptfA2A654 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BptfA2A654 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BptfA2A654 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BptfA2A654 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BptfA2A654 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BptfA2A654 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BptfA2A654 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BptfA2A654 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BptfA2A654 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BptfA2A654 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BptfA2A654 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BptfA2A654 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BptfA2A654 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BptfA2A654 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BptfA2A654 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BptfA2A654 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BptfA2A654 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BptfA2A654 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BptfA2A654 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BptfA2A654 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BptfA2A654 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BptfA2A654 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BptfA2A654 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BptfA2A654 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BptfA2A654 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BptfA2A654 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BptfA2A654 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BptfA2A654 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BptfA2A654 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BptfA2A654 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BptfA2A654 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BptfA2A654 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BptfA2A654 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BptfA2A654 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BptfA2A654 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BptfA2A654 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BptfA2A654 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BptfA2A654 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BptfA2A654 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BptfA2A654 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BptfA2A654 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BptfA2A654 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BptfA2A654 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BptfA2A654 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BptfA2A654 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BptfA2A654 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BptfA2A654 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BptfA2A654 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BptfA2A654 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BptfA2A654 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BptfA2A654 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BptfA2A654 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BptfA2A654 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BptfA2A654 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BptfA2A654 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BptfA2A654 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BptfA2A654 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BptfA2A654 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BptfA2A654 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BptfA2A654 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms