Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fam71e1A1L3C1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fam71e1A1L3C1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fam71e1A1L3C1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Fam71e1A1L3C1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Fam71e1A1L3C1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fam71e1A1L3C1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fam71e1A1L3C1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fam71e1A1L3C1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Fam71e1A1L3C1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Fam71e1A1L3C1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Fam71e1A1L3C1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Fam71e1A1L3C1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Fam71e1A1L3C1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Fam71e1A1L3C1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Fam71e1A1L3C1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Fam71e1A1L3C1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Fam71e1A1L3C1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Fam71e1A1L3C1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Fam71e1A1L3C1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Fam71e1A1L3C1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Fam71e1A1L3C1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Fam71e1A1L3C1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Fam71e1A1L3C1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Fam71e1A1L3C1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Fam71e1A1L3C1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Fam71e1A1L3C1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Fam71e1A1L3C1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Fam71e1A1L3C1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fam71e1A1L3C1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fam71e1A1L3C1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fam71e1A1L3C1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fam71e1A1L3C1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fam71e1A1L3C1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fam71e1A1L3C1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fam71e1A1L3C1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fam71e1A1L3C1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fam71e1A1L3C1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fam71e1A1L3C1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fam71e1A1L3C1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fam71e1A1L3C1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fam71e1A1L3C1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fam71e1A1L3C1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Fam71e1A1L3C1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Fam71e1A1L3C1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Fam71e1A1L3C1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Fam71e1A1L3C1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Fam71e1A1L3C1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fam71e1A1L3C1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fam71e1A1L3C1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fam71e1A1L3C1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fam71e1A1L3C1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fam71e1A1L3C1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fam71e1A1L3C1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fam71e1A1L3C1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fam71e1A1L3C1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fam71e1A1L3C1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fam71e1A1L3C1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fam71e1A1L3C1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Fam71e1A1L3C1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fam71e1A1L3C1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fam71e1A1L3C1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Fam71e1A1L3C1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Fam71e1A1L3C1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fam71e1A1L3C1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Fam71e1A1L3C1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fam71e1A1L3C1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fam71e1A1L3C1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Fam71e1A1L3C1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Fam71e1A1L3C1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Fam71e1A1L3C1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Fam71e1A1L3C1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fam71e1A1L3C1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fam71e1A1L3C1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fam71e1A1L3C1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fam71e1A1L3C1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fam71e1A1L3C1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fam71e1A1L3C1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fam71e1A1L3C1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fam71e1A1L3C1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fam71e1A1L3C1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fam71e1A1L3C1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fam71e1A1L3C1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fam71e1A1L3C1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fam71e1A1L3C1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fam71e1A1L3C1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fam71e1A1L3C1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fam71e1A1L3C1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fam71e1A1L3C1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fam71e1A1L3C1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fam71e1A1L3C1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fam71e1A1L3C1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fam71e1A1L3C1 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fam71e1A1L3C1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fam71e1A1L3C1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Fam71e1A1L3C1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Fam71e1A1L3C1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fam71e1A1L3C1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fam71e1A1L3C1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fam71e1A1L3C1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1386.1 ms