Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YCD0

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A286YCD0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A286YCD0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A286YCD0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A286YCD0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A286YCD0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A286YCD0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A286YCD0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A286YCD0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A286YCD0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A286YCD0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A286YCD0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A286YCD0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A286YCD0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A286YCD0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A286YCD0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A286YCD0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A286YCD0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A286YCD0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A286YCD0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A286YCD0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A286YCD0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A286YCD0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A286YCD0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A286YCD0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A286YCD0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A286YCD0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A286YCD0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A286YCD0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A286YCD0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A286YCD0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A286YCD0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A286YCD0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A286YCD0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A286YCD0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A286YCD0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A286YCD0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A286YCD0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A286YCD0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A286YCD0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A286YCD0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A286YCD0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A286YCD0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A286YCD0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A286YCD0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A286YCD0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A286YCD0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A286YCD0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A286YCD0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A286YCD0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A286YCD0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A286YCD0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A286YCD0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A286YCD0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A286YCD0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A286YCD0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A286YCD0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A286YCD0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A286YCD0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A286YCD0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A286YCD0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A286YCD0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A286YCD0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A286YCD0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A286YCD0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A286YCD0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A286YCD0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A286YCD0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A286YCD0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A286YCD0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A286YCD0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A286YCD0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A286YCD0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A286YCD0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A286YCD0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A286YCD0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A286YCD0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A286YCD0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A286YCD0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A286YCD0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A286YCD0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A286YCD0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A286YCD0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A286YCD0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A286YCD0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A286YCD0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A286YCD0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A286YCD0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A286YCD0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A286YCD0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A286YCD0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A286YCD0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A286YCD0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A286YCD0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A286YCD0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A286YCD0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A286YCD0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A286YCD0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A286YCD0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A286YCD0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A286YCD0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms