Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
6430628N08RikA0A0U1RQ45 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
6430628N08RikA0A0U1RQ45 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
6430628N08RikA0A0U1RQ45 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
6430628N08RikA0A0U1RQ45 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117 ms