Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms