Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WR25

Gm28360, Predicted gene 28360, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28360A0A087WR25 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28360A0A087WR25 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28360A0A087WR25 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28360A0A087WR25 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28360A0A087WR25 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28360A0A087WR25 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm28360A0A087WR25 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm28360A0A087WR25 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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