Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WR25

Gm28360, Predicted gene 28360, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28360A0A087WR25 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28360A0A087WR25 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28360A0A087WR25 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28360A0A087WR25 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28360A0A087WR25 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28360A0A087WR25 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm28360A0A087WR25 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm28360A0A087WR25 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28360A0A087WR25 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm28360A0A087WR25 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm28360A0A087WR25 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms