RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520961.1

RBM12B-206, Transcript of RNA binding motif protein 12B, human

TSL 3

Gene RBM12B, Length 507 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM12B-206	ENST00000520961	RNF186	Q9NXI6	227 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM12B-206	ENST00000520961	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM12B-206	ENST00000520961		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RBM12B-206	ENST00000520961	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RBM12B-206	ENST00000520961	KRT2	P35908	639 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM12B-206	ENST00000520961	TMF1	P82094	1093 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM12B-206	ENST00000520961	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RBM12B-206	ENST00000520961	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM12B-206	ENST00000520961	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM12B-206	ENST00000520961	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM12B-206	ENST00000520961	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RBM12B-206	ENST00000520961	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM12B-206	ENST00000520961	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM12B-206	ENST00000520961	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RBM12B-206	ENST00000520961	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM12B-206	ENST00000520961	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RBM12B-206	ENST00000520961	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM12B-206	ENST00000520961	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RBM12B-206	ENST00000520961	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM12B-206	ENST00000520961	HACL1	Q9UJ83	578 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM12B-206	ENST00000520961	HYKK	A2RU49	373 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	PTGES3L	E9PB15	166 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	HADHA	P40939	763 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	NOV	P48745	357 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	MFAP4	P55083	255 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	DOK6	Q6PKX4	331 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	DYRK2	Q92630	601 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	OSER1	Q9NX31	292 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	LNP1	A1A4G5	178 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	GPI	P06744	558 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	TRIM49	P0CI25	452 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	TRIM49C	P0CI26	452 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	CA6	P23280	308 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	PDX1	P52945	283 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	COMMD2	Q86X83	199 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	PKP2	Q99959	881 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	S1PR5	Q9H228	398 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	KCNK15	Q9H427	330 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	XRCC3	O43542	346 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	VPREB1	P12018	145 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	HOXC13	P31276	330 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	DCAF7	P61962	342 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	ENPP2	Q13822	863 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	IRF3	Q14653	427 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	SPINK14	Q6IE38	97 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	AACS	Q86V21	672 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	CERS3	Q8IU89	383 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	DCLK2	Q8N568	766 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	MPP4	Q96JB8	637 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	MSGN1	A6NI15	193 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	AP3D1	O14617	1153 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	PTP4A3	O75365	173 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	CREG1	O75629	220 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	TNFAIP3	P21580	790 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	SLC6A6	P31641	620 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	ARSE	P51690	589 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	SLC8A3	P57103	927 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM12B-206	ENST00000520961	CXCL9	Q07325	125 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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