RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TLE1Q04724 770 aa25.57■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEPT6Q14141 434 aa25.57■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNAB1Q14722 419 aa25.57■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OOSP2Q86WS3 158 aa25.57■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KMT5CQ86Y97 462 aa25.57■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR13C4Q8NGS5 318 aa25.57■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ULK4Q96C45 1275 aa25.57■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC45Q96CN5 670 aa25.57■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TLCD2A6NGC4 264 aa25.56■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AGAP14A8MT82 685 aa25.56■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BTNL10A8MVZ5 291 aa25.56■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TIAF1O95411 115 aa25.56■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF75DP51815 510 aa25.56■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AADACL2Q6P093 401 aa25.56■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALG3Q92685 438 aa25.56■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FCRL4Q96PJ5 515 aa25.56■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBL1YQ9BQ87 522 aa25.56■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC24A2Q9UI40 661 aa25.56■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SGTAO43765 313 aa25.55■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POLBP06746 335 aa25.55■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EBLN1P0CF75 366 aa25.55■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ITGALP20701 1170 aa25.55■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HADHAP40939 763 aa25.55■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMPRSS15P98073 1019 aa25.55■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERV3-1Q14264 604 aa25.55■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GSE1Q14687 1217 aa25.55■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DENND5AQ6IQ26 1287 aa25.55■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa25.55■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARMC6Q6NXE6 501 aa25.55■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CFAP206Q8IYR0 622 aa25.55■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NXPE1Q8N323 547 aa25.55■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABHD17AQ96GS6 310 aa25.55■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa25.55■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C19orf43Q9BQ61 176 aa25.55■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LACRTQ9GZZ8 138 aa25.55■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM96AQ9H5X1 160 aa25.55■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa25.55■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LHX9Q9NQ69 397 aa25.55■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FGF21Q9NSA1 209 aa25.55■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNMB2Q9Y691 235 aa25.55■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa25.55■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR6C74A6NCV1 312 aa25.54■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CFAP99D6REC4 459 aa25.54■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSD11B2P80365 405 aa25.54■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNASE1L3Q13609 305 aa25.54■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPARCL1Q14515 664 aa25.54■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRT33BQ14525 404 aa25.54■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SKIDA1Q1XH10 827 aa25.54■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CERS6Q6ZMG9 384 aa25.54■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNX20Q7Z614 316 aa25.54■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HM13Q8TCT9 377 aa25.54■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CT55Q8WUE5 264 aa25.54■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HEXDCQ8WVB3 486 aa25.54■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RMDN2Q96LZ7 410 aa25.54■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COPS8Q99627 209 aa25.54■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCM2Q9BSQ5 444 aa25.54■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARNT2Q9HBZ2 717 aa25.54■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANAPC2Q9UJX6 822 aa25.54■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POLHQ9Y253 713 aa25.54■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa25.54■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRLHRP49683 370 aa25.53■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAD9BQ6WBX8 426 aa25.53■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 D2HGDHQ8N465 521 aa25.53■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC57Q8N9N7 239 aa25.53■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa25.53■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HECTD1Q9ULT8 2610 aa25.52■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRID2IPA4D2P6 1211 aa25.52■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C21orf140B9A014 251 aa25.52■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CREG1O75629 220 aa25.52■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTMAP06454 111 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FURINP09958 794 aa25.52■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NDUFS1P28331 727 aa25.52■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VAV2P52735 878 aa25.52■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR33Q49SQ1 333 aa25.52■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa25.52■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa25.52■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CARFQ8N187 725 aa25.52■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACRBPQ8NEB7 543 aa25.52■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TWSG1Q9GZX9 223 aa25.52■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EPN3Q9H201 632 aa25.52■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIPSLA2A3N6 862 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDC14CA4D256 554 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCL22O00626 93 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGAP6O43182 974 aa25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 116.2 ms