RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 SUFUQ9UMX1 484 aa17.98■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa17.98■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 URB1O60287 2271 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 FADS2P1A8MWK0 482 aa17.97■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa17.97■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 NOBOXO60393 691 aa17.97■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 SASH3O75995 380 aa17.97■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 PYGLP06737 847 aa17.97■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 CA5AP35218 305 aa17.97■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 GP5P40197 560 aa17.97■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 MSH2P43246 934 aa17.97■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 TTPAP49638 278 aa17.97■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 ISXQ2M1V0 245 aa17.97■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa17.97■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 PACS1Q6VY07 963 aa17.97■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 NRROSQ86YC3 692 aa17.97■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 NXPE1Q8N323 547 aa17.97■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 GPBAR1Q8TDU6 330 aa17.97■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 CCDC74AQ96AQ1 378 aa17.97■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 CRLS1Q9UJA2 301 aa17.97■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 ZNF180Q9UJW8 692 aa17.97■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 ST14Q9Y5Y6 855 aa17.97■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 BRINP1O60477 761 aa17.96■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 S1PR4O95977 384 aa17.96■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 AHSGP02765 367 aa17.96■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 INHBAP08476 426 aa17.96■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 ACRV1P26436 265 aa17.96■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 GABRB3P28472 473 aa17.96■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 GNPDA1P46926 289 aa17.96■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 MPP1Q00013 466 aa17.96■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 ADGRD1Q6QNK2 874 aa17.96■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 TAS2R42Q7RTR8 314 aa17.96■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 STRA8Q7Z7C7 330 aa17.96■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 TRIM74Q86UV6 250 aa17.96■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 SERPINA9Q86WD7 417 aa17.96■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 DCAKDQ8WVC6 231 aa17.96■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 GLYATL1Q969I3 302 aa17.96■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 COX14Q96I36 57 aa17.96■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 TTC1Q99614 292 aa17.96■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 EURLQ9NYK6 297 aa17.96■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 TXNDC16Q9P2K2 825 aa17.96■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa17.96■□□□□ 0.47
PTX4-201ENST00000293922 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 RASGRF2O14827 1237 aa17.95■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 PFDN6O15212 129 aa17.95■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 ATP8B1O43520 1251 aa17.95■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 CDH16O75309 829 aa17.95■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 PDX1P52945 283 aa17.95■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 DBN1Q16643 649 aa17.95■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 GRTP1Q5TC63 336 aa17.95■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 DOK6Q6PKX4 331 aa17.95■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 CROCCP2Q86T23 111 aa17.95■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 DDHD1Q8NEL9 900 aa17.95■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 OR6C4Q8NGE1 309 aa17.95■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 WDR48Q8TAF3 677 aa17.95■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 LPGAT1Q92604 370 aa17.95■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 HIC2Q96JB3 615 aa17.95■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 DPEP2Q9H4A9 486 aa17.95■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa17.95■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa17.95■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 IKBKGQ9Y6K9 419 aa17.95■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 IGSF10Q6WRI0 2623 aa17.94■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa17.94■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 A0A087WV48 116 aa17.94■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 B4DGG1 531 aa17.94■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 AGPSO00116 658 aa17.94■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 NDUFS3O75489 264 aa17.94■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 FAM155BO75949 473 aa17.94■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 MPOP05164 745 aa17.94■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 AK4P27144 223 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 CD151P48509 253 aa17.94■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 SERPINB9P50453 376 aa17.94■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 ADARP55265 1226 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP17.94■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 ITIH4Q14624 930 aa17.94■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 ZNF789Q5FWF6 425 aa17.94■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 GPRC6AQ5T6X5 926 aa17.94■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 CNPY4Q8N129 248 aa17.94■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 RBBP8Q99708 897 aa17.94■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 GSDMCQ9BYG8 508 aa17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.6 ms