RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000039144.6

Clstn1-201, Transcript of Calsyntenin-1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clstn1, Length 3,319 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Mc1rQ01727 315 aa14.96□□□□□ -0.01
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Ulk3Q3U3Q1 472 aa14.96□□□□□ -0.01
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Nr1d2Q60674 576 aa14.96□□□□□ -0.01
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Galnt2Q6PB93 570 aa14.96□□□□□ -0.01
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Rad9bQ6WBX7 403 aa14.96□□□□□ -0.01
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Ticam2Q8BJQ4 232 aa14.96□□□□□ -0.01
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Znf410Q8BKX7 478 aa14.96□□□□□ -0.01
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Pi4k2bQ8CBQ5 469 aa14.96□□□□□ -0.01
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Znf639Q99KZ6 485 aa14.96□□□□□ -0.01
Clstn1-201ENSMUST00000039144 ApipQ9WVQ5 241 aa14.96□□□□□ -0.01
Clstn1-201ENSMUST00000039144 BC025446A0A087WQT1 134 aa14.96□□□□□ -0.01
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Zfp384E9Q1A5 584 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Btnl2O70355 454 aa14.96□□□□□ -0.01
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Fzd1O70421 642 aa14.96□□□□□ -0.01
Clstn1-201ENSMUST00000039144 BgnP28653 369 aa14.96□□□□□ -0.01
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Sult1e1P49891 295 aa14.96□□□□□ -0.01
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Gm7030Q0WXH6 285 aa14.96□□□□□ -0.01
Clstn1-201ENSMUST00000039144 CrxosQ3UL53 246 aa14.96□□□□□ -0.01
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Xkr5Q5GH66 676 aa14.96□□□□□ -0.01
Clstn1-201ENSMUST00000039144 IspdQ5RJG7 447 aa14.96□□□□□ -0.01
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Mapre1Q61166 268 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
Clstn1-201ENSMUST00000039144 AtminQ6P9S1 818 aa14.96□□□□□ -0.01
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Trim17Q7TPM3 477 aa14.96□□□□□ -0.01
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Stx16Q8BVI5 326 aa14.96□□□□□ -0.01
Clstn1-201ENSMUST00000039144 BroxQ8K2Q7 411 aa14.96□□□□□ -0.01
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Pcdhb21Q91V48 774 aa14.96□□□□□ -0.01
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Pcdhb2Q91Y00 799 aa14.96□□□□□ -0.01
Clstn1-201ENSMUST00000039144 MispQ9D279 648 aa14.96□□□□□ -0.01
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Cnbd2Q9D5U8 673 aa14.96□□□□□ -0.01
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Rhobtb1Q9DAK3 695 aa14.96□□□□□ -0.01
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Olig2Q9EQW6 323 aa14.96□□□□□ -0.01
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Cog8Q9JJA2 640 aa14.96□□□□□ -0.01
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Fads3Q9JJE7 449 aa14.96□□□□□ -0.01
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Cdh17Q9R100 827 aa14.96□□□□□ -0.01
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Klhdc7bA0A286YD60 1263 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Iqca1lA6H690 825 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Gpr15Q0VDU3 360 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Tmem173Q3TBT3 378 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Shcbp1lQ3TTP0 639 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Cyp3a13Q64464 503 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Xpo1Q6P5F9 1071 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Akr1c13Q8VC28 323 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Bbox1Q924Y0 387 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Tpgs1Q99MS8 303 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 9030624G23RikQ9D308 155 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Nmnat1Q9EPA7 285 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Ighv11-1A0A075B5R6 117 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Mcf2A2AEU1 1111 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Tex28B1AYN9 409 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 A930018M24RikB7ZMY3 218 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Gm8369E9PZI3 166 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 P01668 110 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Traf2P39429 501 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Inpp5jP59644 1003 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Hp1bp3Q3TEA8 554 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Ppm1hQ3UYC0 513 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Clec12aQ504P2 267 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Prss36Q5K2P8 849 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Adora2aQ60613 410 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Olfr1415Q7TQS4 311 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Dnajc16Q80TN4 772 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Pcid2Q8BFV2 399 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Olfr1416Q8VGU4 312 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Ppa2Q91VM9 330 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Dlgap1Q9D415 992 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Dnajb4Q9D832 337 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 LactbQ9EP89 551 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 MndalD0QMC3 538 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 TpteG5E8H5 664 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Gm3696K7N751 203 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Sec22bO08547 215 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Clcn7O70496 803 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 MycP01108 439 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Pax3P24610 479 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Gdf6P43028 454 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Sat1P48026 171 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Polr3bP59470 1133 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Ms4a15Q3UPL6 245 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Pnpla1Q3V1D5 599 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Serpina3gQ5I2A0 440 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Olfr1062Q7TR71 315 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Tecpr1Q80VP0 1166 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Vac14Q80WQ2 782 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Vwa1Q8R2Z5 415 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 MrgpreQ91ZB7 310 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 CrebzfQ91ZR3 358 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Yif1bQ9CX30 311 aa14.95□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Gm13276A0A087WR18 182 aa14.94□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Gm6657A0A1B0GRJ3 277 aa14.94□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Vmn2r91E9Q2U5 856 aa14.94□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Klf10O89091 479 aa14.94□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Cd247P24161 164 aa14.94□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Ufm1P61961 85 aa14.94□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Six4Q61321 775 aa14.94□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Pex11gQ6P6M5 241 aa14.94□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Mta1Q8K4B0 715 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Ttc39cQ8VE09 580 aa14.94□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Gins4Q99LZ3 223 aa14.94□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Pbld2Q9CXN7 288 aa14.94□□□□□ -0.02
Clstn1-201ENSMUST00000039144 Hmg20aQ9DC33 346 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45.3 ms