RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466861.1

SUMO3-205, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2

Gene SUMO3, Length 753 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-205ENST00000466861 KLC4Q9NSK0 619 aa22.95■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa22.95■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 CDC23Q9UJX2 597 aa22.95■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 KCNK6Q9Y257 313 aa22.95■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 FAM187AA6NFU0 413 aa22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 F8W8V4 182 aa22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 OPA1O60313 960 aa22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 AP2A2O94973 939 aa22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 GOT2P00505 430 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 F3P13726 295 aa22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 NSG1P42857 185 aa22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 GPR3P46089 330 aa22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 CTSCP53634 463 aa22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 B4GALNT1Q00973 533 aa22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 MORF4L2Q15014 288 aa22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 IYDQ6PHW0 289 aa22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 TAS2R42Q7RTR8 314 aa22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 PIANPQ8IYJ0 282 aa22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 MPP5Q8N3R9 675 aa22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 MAPK15Q8TD08 544 aa22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 FAM96AQ9H5X1 160 aa22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 VPS37BQ9H9H4 285 aa22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 SYBUQ9NX95 663 aa22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 SAMD15Q9P1V8 674 aa22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 TBC1D29Q9UFV1 150 aa22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 SLC23A2Q9UGH3 650 aa22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 UNC13CQ8NB66 2214 aa22.94■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa22.93■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa22.93■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 MGAT4DA6NG13 374 aa22.93■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 TCEA3O75764 348 aa22.93■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 POP7O75817 140 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 MYF5P13349 255 aa22.93■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 PAMP19021 973 aa22.93■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 IDSP22304 550 aa22.93■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 PRLHRP49683 370 aa22.93■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 DBN1Q16643 649 aa22.93■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 CCDC157Q569K6 752 aa22.93■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 ARL14Q8N4G2 192 aa22.93■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 OR6P1Q8NGX9 317 aa22.93■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 GRAMD1AQ96CP6 724 aa22.93■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 KRT12Q99456 494 aa22.93■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 SCNM1Q9BWG6 230 aa22.93■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 ABCG4Q9H172 646 aa22.93■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 LRIT1Q9P2V4 623 aa22.93■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 MSRB2Q9Y3D2 182 aa22.93■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 CCDC78A2IDD5 438 aa22.92■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 TTI1O43156 1089 aa22.92■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 SGTAO43765 313 aa22.92■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 CRADDP78560 199 aa22.92■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 PERM1Q5SV97 790 aa22.92■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 FNBP1LQ5T0N5 605 aa22.92■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 CDCP2Q5VXM1 449 aa22.92■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 IZUMO3Q5VZ72 239 aa22.92■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 BBOF1Q8ND07 529 aa22.92■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 OR2L2Q8NH16 312 aa22.92■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 CCDC74AQ96AQ1 378 aa22.92■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 SH3KBP1Q96B97 665 aa22.92■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 SGF29Q96ES7 293 aa22.92■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 CCDC3Q9BQI4 270 aa22.92■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 ANAPC5Q9UJX4 755 aa22.92■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 OR2AG2A6NM03 316 aa22.91■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 AVILO75366 819 aa22.91■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 NMBRP28336 390 aa22.91■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 TTPAP49638 278 aa22.91■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa22.91■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 HES3Q5TGS1 186 aa22.91■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 TMEM135Q86UB9 458 aa22.91■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 SLC9B2Q86UD5 537 aa22.91■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 SNF8Q96H20 258 aa22.91■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 NAT9Q9BTE0 207 aa22.91■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa22.91■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 CATSPERZQ9NTU4 200 aa22.91■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 ACSL5Q9ULC5 683 aa22.91■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 RNF215Q9Y6U7 377 aa22.91■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 RHPN2P1A8MT19 583 aa22.9■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 TERF1P54274 439 aa22.9■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 MAZP56270 477 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 CBLBQ13191 982 aa22.9■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 BIRC2Q13490 618 aa22.9■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa22.9■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 METRNLQ641Q3 311 aa22.9■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SUMO3-205ENST00000466861 CASC4Q6P4E1 433 aa22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms