RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233190.10

NDUFS1-201, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NDUFS1, Length 11,819 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1-201ENST00000233190 GPAT4Q86UL3 456 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 UNC5BQ8IZJ1 945 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 C11orf65Q8NCR3 313 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 CDCA5Q96FF9 252 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 EFCAB10A6NFE3 127 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 PPP1R37O75864 691 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 TCF4P15884 667 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 MC4RP32245 332 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 MMP13P45452 471 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 TRAF2Q12933 501 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 RAPSNQ13702 412 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 GRM4Q14833 912 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 ACSM3Q53FZ2 586 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 UBA3Q8TBC4 463 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 TEX47Q8TBZ9 253 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 EEF2KMTQ96G04 330 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 CYP3A43Q9HB55 503 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 ZNF175Q9Y473 711 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 KAT7O95251 611 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 ECHS1P30084 290 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 MALLQ13021 153 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 HYIQ5T013 277 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 C12orf56Q8IXR9 622 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 RASGEF1CQ8N431 466 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 OR56A4Q8NGH8 313 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 MS4A14Q96JA4 679 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 FAM205AQ6ZU69 1335 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 KIR3DL1P43629 444 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 FUT11Q495W5 492 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 LAPTM4BQ86VI4 370 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 TMEM17Q86X19 198 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 LMX1AQ8TE12 382 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 RIT2Q99578 217 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 DUSP23Q9BVJ7 150 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 ATPIF1Q9UII2 106 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 TBX3O15119 743 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 VDRP11473 427 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 LIFRP42702 1097 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 GRK6P43250 576 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 KIR2DL3P43628 341 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 NR2C2P49116 596 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 LRP8Q14114 963 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 E2F2Q14209 437 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 FAM83AQ86UY5 434 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 Q8N402 240 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 PLEK2Q9NYT0 353 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 HCN2Q9UL51 889 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 NEDD4P46934 1319 aa6.89□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 TRIM43BA6NCK2 446 aa6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 ANKRD28O15084 1053 aa6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 ZNF81P51508 661 aa6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 GNGT1P63211 74 aa6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 DSC3Q14574 896 aa6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 TTLQ8NG68 377 aa6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 APOPT1Q96IL0 206 aa6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 ASB8Q9H765 288 aa6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 GTF3C4Q9UKN8 822 aa6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 HNF4AP41235 474 aa6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 STARP49675 285 aa6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 ZNF84P51523 738 aa6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 COASYQ13057 564 aa6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 GPR142Q7Z601 462 aa6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 RHBDD1Q8TEB9 315 aa6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 TRIB2Q92519 343 aa6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 KLHL15Q96M94 604 aa6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 PLSCR5A0PG75 271 aa6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 PRR5P85299 388 aa6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 CXCL17Q6UXB2 119 aa6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 ZNF610Q8N9Z0 462 aa6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 HELQQ8TDG4 1101 aa6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 NXPE2Q96DL1 559 aa6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 FAM83DQ9H4H8 585 aa6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 IQGAP3Q86VI3 1631 aa6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 TFECO14948 347 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 DUX1O43812 170 aa6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 ATG12O94817 140 aa6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 AHSGP02765 367 aa6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 FAM58BPP0C7Q3 252 aa6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 PFKLP17858 780 aa6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 RPS9P46781 194 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 TUBP50607 506 aa6.88□□□□□ -1.31
NDUFS1-201ENST00000233190 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56 ms