RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 TBPL2Q6SJ96 375 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 PID1Q7Z2X4 250 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 LIMS2Q7Z4I7 341 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 PJA1Q8NG27 643 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 NTAN1Q96AB6 310 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 TREX1Q9NSU2 369 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 DERAQ9Y315 318 aa9.92□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 USP12O75317 370 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 FGF4P08620 206 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 AVPR1AP37288 418 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 ALDH3A2P51648 485 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 PGGT1BP53609 377 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 BCAT1P54687 386 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 YBX1P67809 324 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 ZNF33AQ06730 810 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 DPY19L1Q2PZI1 675 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 BTBD8Q5XKL5 378 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 FKBP9P1Q75LS8 142 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 TRIM50Q86XT4 487 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 OSCP1Q8WVF1 389 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 ZNF566Q969W8 418 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 HSFY1Q96LI6 401 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 SLC9A7Q96T83 725 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 DPP3Q9NY33 737 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 TLL2Q9Y6L7 1015 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 A0A0J9YYE9 177 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 ALPLP05186 524 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 IMPDH1P20839 514 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 ELK4P28324 431 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 ETFBP38117 255 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 TRIM32Q13049 653 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 INAVAQ3KP66 663 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 PCID2Q5JVF3 399 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 ZNF618Q5T7W0 954 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 LAIR2Q6ISS4 152 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 SLC22A9Q8IVM8 553 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 CCNYL1Q8N7R7 359 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 LRRC58Q96CX6 371 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 NRBF2Q96F24 287 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 TXNDC15Q96J42 360 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 FEM1AQ9BSK4 669 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 FUNDC2Q9BWH2 189 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 SEPT10Q9P0V9 454 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 MIA3Q5JRA6 1907 aa9.91□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 ASPDHA6ND91 283 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 PRR35P0CG20 571 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 YWHAQP27348 245 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 HTR1BP28222 390 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 YAP1P46937 504 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 PYCR3Q53H96 274 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 PRSS48Q7RTY5 328 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 ACOT1Q86TX2 421 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 C19orf60Q96EN9 201 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 TEKT5Q96M29 485 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 C3orf30Q96M34 536 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 OMDQ99983 421 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 SP140LQ9H930 580 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 TMEM45AQ9NWC5 275 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 IFT52Q9Y366 437 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 PLXNB2O15031 1838 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 PATJQ8NI35 1801 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 GRXCR2A6NFK2 248 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 UBXN8O00124 270 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 SPTLC1O15269 473 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 SUPT7LO94864 414 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 HRH2P25021 359 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 HTR1EP28566 365 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 SLC1A2P43004 574 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 TAS2R39P59534 338 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 SEPT6Q14141 434 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 ZNF678Q5SXM1 525 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 KANK2Q63ZY3 851 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 DENND5AQ6IQ26 1287 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 METTL7BQ6UX53 244 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 CRYBG2Q8N1P7 616 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 LRRC71Q8N4P6 559 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 NPWQ8N729 165 aa9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 120.6 ms