RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 KDM3BQ7LBC6 1761 aa6.48□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 DFFAO00273 331 aa6.48□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 PRMT3O60678 531 aa6.48□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 DNAJB2P25686 324 aa6.48□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 FAUP35544 74 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 NPY2RP49146 381 aa6.48□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa6.48□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 PNCKQ6P2M8 343 aa6.48□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 MOXD1Q6UVY6 613 aa6.48□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF804BA4D1E1 1349 aa6.47□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 UBAP1LF5GYI3 381 aa6.47□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 ALDH4A1P30038 563 aa6.47□□□□□ -1.37
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SBNO1-202ENST00000420886 PMS2P3Q13401 168 aa6.47□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 KIZQ2M2Z5 673 aa6.47□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 MFSD7Q6UXD7 560 aa6.47□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 FAM92BQ6ZTR7 304 aa6.47□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 EPHX4Q8IUS5 362 aa6.47□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 SLC9A9Q8IVB4 645 aa6.47□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 CPXM1Q96SM3 734 aa6.47□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 ITPAQ9BY32 194 aa6.47□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 ANKRD60Q9BZ19 345 aa6.47□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 STK32BQ9NY57 414 aa6.47□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 ACTR3BQ9P1U1 418 aa6.47□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 METTL21EPA6NDL7 271 aa6.47□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 PRAMEF1O95521 474 aa6.47□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 LBPP18428 481 aa6.47□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 CD72P21854 359 aa6.47□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 UQCRC1P31930 480 aa6.47□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 ATP12AP54707 1039 aa6.47□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 SLC12A3P55017 1021 aa6.47□□□□□ -1.37
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SBNO1-202ENST00000420886 AKIRIN2Q53H80 203 aa6.47□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 EPS8L1Q8TE68 723 aa6.47□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 ASB15Q8WXK1 588 aa6.47□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 SH2D3AQ9BRG2 576 aa6.47□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 IL22Q9GZX6 179 aa6.47□□□□□ -1.37
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SBNO1-202ENST00000420886 EI24O14681 340 aa6.47□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 GMDSO60547 372 aa6.47□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 PGLSO95336 258 aa6.47□□□□□ -1.37
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SBNO1-202ENST00000420886 STX4Q12846 297 aa6.47□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 CDK10Q15131 360 aa6.47□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 SLC27A3Q5K4L6 730 aa6.47□□□□□ -1.37
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SBNO1-202ENST00000420886 SETD6Q8TBK2 473 aa6.47□□□□□ -1.37
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SBNO1-202ENST00000420886 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
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SBNO1-202ENST00000420886 CATSPER4Q7RTX7 472 aa6.47□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF720Q7Z2F6 126 aa6.47□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.47□□□□□ -1.37
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SBNO1-202ENST00000420886 CERS2Q96G23 380 aa6.47□□□□□ -1.37
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SBNO1-202ENST00000420886 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 TFEBP19484 476 aa6.47□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 RFC4P35249 363 aa6.47□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 POLD2P49005 469 aa6.47□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SBNO1-202ENST00000420886 KYAT1Q16773 422 aa6.47□□□□□ -1.37
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