RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261058.2

CCDC54-201, Transcript of coiled-coil domain containing 54, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CCDC54, Length 1,444 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC54-201ENST00000261058 BPIFA1Q9NP55 256 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 TMEM51Q9NW97 253 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 NRBP1Q9UHY1 535 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 EVPLQ92817 2033 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 INAFM1C9JVW0 142 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 J3KR12 359 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 SNAP23O00161 211 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 SCAMP1O15126 338 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 CD58P19256 250 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 CALRP27797 417 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 ENTPD1P49961 510 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 PRKG2Q13237 762 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 C2orf68Q2NKX9 166 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 SARM1Q6SZW1 724 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 Q6ZTK2 550 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 IKBIPQ70UQ0 350 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 WDTC1Q8N5D0 677 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 SCCPDHQ8NBX0 429 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 AGBL3Q8NEM8 1001 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 TRIB2Q92519 343 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 ERGIC1Q969X5 290 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 KIF9Q9HAQ2 790 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 CEPT1Q9Y6K0 416 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 FRMD3A2A2Y4 597 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 TMEM202A6NGA9 273 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 TIMM23O14925 209 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 HCRTR2O43614 444 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 MTA2O94776 668 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 FTCDO95954 541 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 NAGAP17050 411 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 MAOAP21397 527 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 NFKBIAP25963 317 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 ARRB2P32121 409 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 PSMB10P40306 273 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 PGGT1BP53609 377 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 RAD23BP54727 409 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 F2RL1P55085 397 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 JADE1Q6IE81 842 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 GSTA5Q7RTV2 222 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 PALB2Q86YC2 1186 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 PRR26Q8N8Z3 221 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 SCFD2Q8WU76 684 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 SGCDQ92629 289 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 ARHGEF26Q96DR7 871 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 FCRL4Q96PJ5 515 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 KCNN2Q9H2S1 579 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 OR6C3Q9NZP0 311 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 RNF7Q9UBF6 113 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 GPR34Q9UPC5 381 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 A0A1B0GVM2 712 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 TIPRLO75663 272 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 VNN2O95498 520 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 PTMAP06454 111 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 RARGP13631 454 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 HADHAP40939 763 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 GARSP41250 739 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 NUDT6P53370 316 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 ITGADQ13349 1161 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 FNBP1LQ5T0N5 605 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 TTC39CQ8N584 583 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 SCARB1Q8WTV0 552 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 C1orf74Q96LT6 269 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 TMEM68Q96MH6 324 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 TIGD1Q96MW7 591 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 TMEM47Q9BQJ4 181 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 SPRY4Q9C004 299 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 LTB4R2Q9NPC1 389 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 FZD10Q9ULW2 581 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 A0A1B0GVT2 93 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC54-201ENST00000261058 CPED1A4D0V7 1026 aa4.53□□□□□ -1.68
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