RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471023.1

NOP56-211, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 2

Gene NOP56, Length 592 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-211ENST00000471023 TSGA10Q9BZW7 698 aa7.57□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa7.57□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa7.57□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 LZTFL1Q9NQ48 299 aa7.57□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 PRSS16Q9NQE7 514 aa7.57□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 DTLQ9NZJ0 730 aa7.57□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 LHX3Q9UBR4 397 aa7.57□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 PILRBQ9UKJ0 227 aa7.57□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 RAD54BQ9Y620 910 aa7.57□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 ABCA7Q8IZY2 2146 aa7.57□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 IGF2RP11717 2491 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 CCDC66A2RUB6 948 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 LRRD1A4D1F6 860 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 PCNX2A6NKB5 2137 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 KRT86O43790 486 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 SPOPO43791 374 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 OPHN1O60890 802 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 RAMP2O60895 175 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 NDUFS2O75306 463 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 KRT1P04264 644 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 CFIP05156 583 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 CTSLP07711 333 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 ENGP17813 658 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 GABRG2P18507 467 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 CR2P20023 1033 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 OXTRP30559 389 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 RGRP47804 291 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 METAP1P53582 386 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 ZNF33AQ06730 810 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 ZNF423Q2M1K9 1284 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 PARP15Q460N3 678 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 WDR45BQ5MNZ6 344 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 LEKR1Q6ZMV7 388 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 BBS12Q6ZW61 710 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 GALNT12Q8IXK2 581 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 TMEFF1Q8IYR6 380 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 RCOR2Q8IZ40 523 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 PGBD5Q8N414 524 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 TEX26Q8N6G2 289 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 KCTD6Q8NC69 237 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 OR2A12Q8NGT7 310 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 UCMAQ8WVF2 138 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 MAML1Q92585 1016 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 FATE1Q969F0 183 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 TSGA13Q96PP4 275 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 CIPCQ9C0C6 399 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 SLC6A17Q9H1V8 727 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 ATP13A1Q9HD20 1204 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 CD93Q9NPY3 652 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 VPS28Q9UK41 221 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 EFR3BQ9Y2G0 817 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa7.56□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 FAM221BA6H8Z2 402 aa7.55□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 GJB3O75712 270 aa7.55□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.26e-9■□□□□ 9.3
NOP56-211ENST00000471023 IGLV3-19P01714 112 aa7.55□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 TNNT1P13805 278 aa7.55□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 EDN3P14138 238 aa7.55□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 HOXB2P14652 356 aa7.55□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 DESP17661 470 aa7.55□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 BCKDHBP21953 392 aa7.55□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 ITPKAP23677 461 aa7.55□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 ARL4AP40617 200 aa7.55□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 PTGER3P43115 390 aa7.55□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 SSR1P43307 286 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 SULT2A1Q06520 285 aa7.55□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 IL10RBQ08334 325 aa7.55□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 SLC20A2Q08357 652 aa7.55□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 SLC10A7Q0GE19 358 aa7.55□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 KRT81Q14533 505 aa7.55□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 STARD3Q14849 445 aa7.55□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 LLGL1Q15334 1064 aa7.55□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 DLG2Q15700 870 aa7.55□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 C22orf39Q6P5X5 142 aa7.55□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 TMCO3Q6UWJ1 677 aa7.55□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 PEX26Q7Z412 305 aa7.55□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 LZTR1Q8N653 840 aa7.55□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 IL22RA1Q8N6P7 574 aa7.55□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 CNTD1Q8N815 330 aa7.55□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 FRMD1Q8N878 549 aa7.55□□□□□ -1.2
NOP56-211ENST00000471023 CHST14Q8NCH0 376 aa7.55□□□□□ -1.2
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