RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498280.1

RBM39-242, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 444 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-242ENST00000498280 TSC1Q92574 1164 aa6.51□□□□□ -1.37
RBM39-242ENST00000498280 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa6.51□□□□□ -1.37
RBM39-242ENST00000498280 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RBM39-242ENST00000498280 IGHA1P01876 353 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-242ENST00000498280 PTSQ03393 145 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-242ENST00000498280 RNFT1Q5M7Z0 435 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-242ENST00000498280 CCDC116Q8IYX3 515 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-242ENST00000498280 LILRB3O75022 631 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-242ENST00000498280 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RBM39-242ENST00000498280 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RBM39-242ENST00000498280 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa6.48□□□□□ -1.37
RBM39-242ENST00000498280 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RBM39-242ENST00000498280 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RBM39-242ENST00000498280 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RBM39-242ENST00000498280 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RBM39-242ENST00000498280 POLR3EQ9NVU0 708 aa6.48□□□□□ -1.37
RBM39-242ENST00000498280 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.48□□□□□ -1.37
RBM39-242ENST00000498280 FOXK2Q01167 660 aa6.47□□□□□ -1.37
RBM39-242ENST00000498280 KANK3Q6NY19 840 aa6.47□□□□□ -1.37
RBM39-242ENST00000498280 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa6.47□□□□□ -1.37
RBM39-242ENST00000498280 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RBM39-242ENST00000498280 MARSP56192 900 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RBM39-242ENST00000498280 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-242ENST00000498280 CCDC155Q8N6L0 562 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-242ENST00000498280 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.38
RBM39-242ENST00000498280 CDC14CA4D256 554 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-242ENST00000498280 SPINT1O43278 529 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-242ENST00000498280 ARHGEF15O94989 841 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-242ENST00000498280 SLURP2P0DP57 97 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-242ENST00000498280 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RBM39-242ENST00000498280 CARD14Q9BXL6 1004 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-242ENST00000498280 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RBM39-242ENST00000498280 FIGNL2A6NMB9 653 aa6.44□□□□□ -1.38
RBM39-242ENST00000498280 ITGA6P23229 1130 aa6.44□□□□□ -1.38
RBM39-242ENST00000498280 CTDSPL2Q05D32 466 aa6.44□□□□□ -1.38
RBM39-242ENST00000498280 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RBM39-242ENST00000498280 SLC10A4Q96EP9 437 aa6.44□□□□□ -1.38
RBM39-242ENST00000498280 SLC35F4A4IF30 521 aa6.43□□□□□ -1.38
RBM39-242ENST00000498280 ADAM23O75077 832 aa6.43□□□□□ -1.38
RBM39-242ENST00000498280 CLK2P49760 499 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RBM39-242ENST00000498280 MAP3K10Q02779 954 aa6.43□□□□□ -1.38
RBM39-242ENST00000498280 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RBM39-242ENST00000498280 Q6ZVU0 165 aa6.43□□□□□ -1.38
RBM39-242ENST00000498280 SV2AQ7L0J3 742 aa6.43□□□□□ -1.38
RBM39-242ENST00000498280 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RBM39-242ENST00000498280 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.43□□□□□ -1.38
RBM39-242ENST00000498280 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.42□□□□□ -1.38
RBM39-242ENST00000498280 LRRN4Q8WUT4 740 aa6.42□□□□□ -1.38
RBM39-242ENST00000498280 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
RBM39-242ENST00000498280 CBLBQ13191 982 aa6.41□□□□□ -1.38
RBM39-242ENST00000498280 ERFEQ4G0M1 354 aa6.41□□□□□ -1.38
RBM39-242ENST00000498280 VWA5B2Q8N398 1253 aa6.41□□□□□ -1.38
RBM39-242ENST00000498280 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
RBM39-242ENST00000498280 ADAMTS2O95450 1211 aa6.39□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 EPS8L1Q8TE68 723 aa6.39□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 OCSTAMPQ9BR26 566 aa6.39□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa6.39□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 ENAMQ9NRM1 1142 aa6.39□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 MSTNO14793 375 aa6.38□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 RELBQ01201 579 aa6.38□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 NR6A1Q15406 480 aa6.38□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa6.38□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.38□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 FAM117AQ9C073 453 aa6.38□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 ITGB2P05107 769 aa6.37□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 LYPD4Q6UWN0 246 aa6.37□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 RNF217Q8TC41 542 aa6.37□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 PHF20L1A8MW92 1017 aa6.36□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 NBPF20Q3BBV1 942 aa6.36□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 PDXDC2PQ6P474 469 aa6.36□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 PODNQ7Z5L7 613 aa6.36□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 ZBTB33Q86T24 672 aa6.36□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 AGBL1Q96MI9 1066 aa6.36□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 KDM4CQ9H3R0 1056 aa6.36□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 DCAF5Q96JK2 942 aa6.35□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 RSPH6AQ9H0K4 717 aa6.35□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa6.34□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 ADH1AP07327 375 aa6.34□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP6.34□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.34□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 FKBPLQ9UIM3 349 aa6.34□□□□□ -1.39
RBM39-242ENST00000498280 PROCP04070 461 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-242ENST00000498280 TRIM52Q96A61 297 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-242ENST00000498280 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa6.32□□□□□ -1.4
RBM39-242ENST00000498280 AP1G2O75843 785 aa6.32□□□□□ -1.4
RBM39-242ENST00000498280 SH3D19Q5HYK7 790 aa6.32□□□□□ -1.4
RBM39-242ENST00000498280 GALNT6Q8NCL4 622 aa6.32□□□□□ -1.4
RBM39-242ENST00000498280 GMCL1Q96IK5 515 aa6.32□□□□□ -1.4
RBM39-242ENST00000498280 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.32□□□□□ -1.4
RBM39-242ENST00000498280 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.31□□□□□ -1.4
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