RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 BCL9LQ86UU0 1499 aa26.42■■□□□ 1.82
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HOXD11-201ENST00000249504 RALBP1Q15311 655 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXD11-201ENST00000249504 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
HOXD11-201ENST00000249504 RGPD5Q99666 1765 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXD11-201ENST00000249504 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXD11-201ENST00000249504 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXD11-201ENST00000249504 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
HOXD11-201ENST00000249504 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
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HOXD11-201ENST00000249504 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.81
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HOXD11-201ENST00000249504 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
HOXD11-201ENST00000249504 ATRNO75882 1429 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXD11-201ENST00000249504 RTL1A6NKG5 1358 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXD11-201ENST00000249504 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
HOXD11-201ENST00000249504 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
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HOXD11-201ENST00000249504 IP6K1Q92551 441 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXD11-201ENST00000249504 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
HOXD11-201ENST00000249504 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26.34■■□□□ 1.81
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HOXD11-201ENST00000249504 VPS72Q15906 364 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXD11-201ENST00000249504 PEAK1Q9H792 1746 aa26.33■■□□□ 1.8
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HOXD11-201ENST00000249504 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXD11-201ENST00000249504 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.31■■□□□ 1.8
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HOXD11-201ENST00000249504 POLKQ9UBT6 870 aa26.31■■□□□ 1.8
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HOXD11-201ENST00000249504 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
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HOXD11-201ENST00000249504 ANKRD24Q8TF21 1146 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXD11-201ENST00000249504 ERBB3P21860 1342 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXD11-201ENST00000249504 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
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HOXD11-201ENST00000249504 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
HOXD11-201ENST00000249504 CRB1P82279 1406 aa26.26■■□□□ 1.8
HOXD11-201ENST00000249504 GLI3P10071 1580 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXD11-201ENST00000249504 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXD11-201ENST00000249504 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXD11-201ENST00000249504 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
HOXD11-201ENST00000249504 INSRP06213 1382 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXD11-201ENST00000249504 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXD11-201ENST00000249504 USP35Q9P2H5 1018 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD11-201ENST00000249504 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD11-201ENST00000249504 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
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HOXD11-201ENST00000249504 NLRP2Q9NX02 1062 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXD11-201ENST00000249504 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXD11-201ENST00000249504 RGPD2P0DJD1 1756 aa26.19■■□□□ 1.78
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HOXD11-201ENST00000249504 CARD10Q9BWT7 1032 aa26.19■■□□□ 1.78
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HOXD11-201ENST00000249504 A0A0G2JS52 829 aa26.17■■□□□ 1.78
HOXD11-201ENST00000249504 MYT1Q01538 1121 aa26.17■■□□□ 1.78
HOXD11-201ENST00000249504 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC184Q52MB2 194 aa26.15■■□□□ 1.78
HOXD11-201ENST00000249504 WNK3Q9BYP7 1800 aa26.15■■□□□ 1.78
HOXD11-201ENST00000249504 RGS12O14924 1447 aa26.14■■□□□ 1.78
HOXD11-201ENST00000249504 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
HOXD11-201ENST00000249504 BARGINQ6ZT62 677 aa26.14■■□□□ 1.77
HOXD11-201ENST00000249504 CFAP53Q96M91 514 aa26.12■■□□□ 1.77
HOXD11-201ENST00000249504 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXD11-201ENST00000249504 NBPF6Q5VWK0 638 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXD11-201ENST00000249504 NBPF4Q96M43 638 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXD11-201ENST00000249504 MRS2Q9HD23 443 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXD11-201ENST00000249504 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
HOXD11-201ENST00000249504 SEPT12Q8IYM1 358 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD11-201ENST00000249504 USHBP1Q8N6Y0 703 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD11-201ENST00000249504 ILDR2Q71H61 639 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD11-201ENST00000249504 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
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HOXD11-201ENST00000249504 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
HOXD11-201ENST00000249504 EYA1Q99502 592 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD11-201ENST00000249504 DISP2A7MBM2 1401 aa26.05■■□□□ 1.76
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HOXD11-201ENST00000249504 IL13P35225 146 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXD11-201ENST00000249504 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD11-201ENST00000249504 LRRC37A3O60309 1634 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD11-201ENST00000249504 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXD11-201ENST00000249504 IGSF1Q8N6C5 1336 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXD11-201ENST00000249504 NCAPD2Q15021 1401 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXD11-201ENST00000249504 DDB1Q16531 1140 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXD11-201ENST00000249504 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
HOXD11-201ENST00000249504 MEGF6O75095 1541 aa26■■□□□ 1.75
HOXD11-201ENST00000249504 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
HOXD11-201ENST00000249504 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
HOXD11-201ENST00000249504 KRT27Q7Z3Y8 459 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXD11-201ENST00000249504 NUDCQ9Y266 331 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXD11-201ENST00000249504 PDE3BQ13370 1112 aa25.98■■□□□ 1.75
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