RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520400.5

CTNNA1-222, Transcript of catenin alpha 1, human

TSL 4

Gene CTNNA1, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTNNA1-222	ENST00000520400	SLC32A1	Q9H598	525 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	TBX20	Q9UMR3	447 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	ICK	Q9UPZ9	632 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400		B4E171	279 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	RNF8	O76064	485 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	DDAH2	O95865	285 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	CELA2A	P08217	269 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	XBP1	P17861	261 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	TFEB	P19484	476 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	EDN2	P20800	178 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	PRKCH	P24723	683 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	TSPAN7	P41732	249 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	INHBE	P58166	350 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	NAA25	Q14CX7	972 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	RPE65	Q16518	533 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	SLC18A3	Q16572	532 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	BAK1	Q16611	211 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	SLC22A25	Q6T423	547 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	C17orf99	Q6UX52	265 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	GPSM1	Q86YR5	675 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	KLB	Q86Z14	1044 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	TEX19	Q8NA77	164 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	LDLRAD4	O15165	306 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	SPTLC2	O15270	562 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	MBD4	O95243	580 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	NFATC1	O95644	943 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	F9	P00740	461 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	CTSA	P10619	480 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	RGS2	P41220	211 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	CASP6	P55212	293 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	STIM1	Q13586	685 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	PLK5	Q496M5	336 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400		Q4G0T1	1027 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZNF766	Q5HY98	468 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	KAT2B	Q92831	832 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	HIPK3	Q9H422	1215 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	PREB	Q9HCU5	417 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	MAFF	Q9ULX9	164 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	TTC3	P53804	2025 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400		A6NNC1	897 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400		E5RJQ4	531 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	TGFB1I1	O43294	461 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	USP12	O75317	370 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	ADA	P00813	363 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	TNNT1	P13805	278 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	KLRC2	P26717	231 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	HSF1	Q00613	529 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZNF91	Q05481	1191 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	GALNT3	Q14435	633 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	SYTL3	Q4VX76	610 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	FAM57B	Q71RH2	274 aa		4.92	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.9 ms