RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440184.1

CBX1P1-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P1, Length 427 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P1-201ENST00000440184 GTSE1Q9NYZ3 720 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 CEP72Q9P209 647 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 DNAI1Q9UI46 699 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 TNFSF13BQ9Y275 285 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 INSL5Q9Y5Q6 135 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 PIAS3Q9Y6X2 628 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 AKAP13Q12802 2813 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 FRYQ5TBA9 3013 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 ARHGEF37A1IGU5 675 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 C2orf78A6NCI8 922 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 HEPACAM2A8MVW5 462 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 TISP43B9A030 160 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 DCLK1O15075 740 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 EXTL3O43909 919 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 MOSPD3O75425 235 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 ECI2O75521 394 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 PRAMEF12O95522 483 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 CXCL8P10145 99 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 MUTP22033 750 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 TGM1P22735 817 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 PROZP22891 400 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 NMT1P30419 496 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 ELF1P32519 619 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 NPTX2P47972 431 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 GPR15P49685 360 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 EFNA5P52803 228 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 PLD1Q13393 1074 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 CTXN3Q4LDR2 81 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 PITRM1Q5JRX3 1037 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 ALKAL1Q6UXT8 129 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 CLEC14AQ86T13 490 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 TTC30AQ86WT1 665 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 OR14K1Q8NGZ2 314 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 WDR92Q96MX6 357 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 GNRHR2Q96P88 292 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 TCHPQ9BT92 498 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 ZSCAN32Q9NX65 697 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 DLL3Q9NYJ7 618 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 LRWD1Q9UFC0 647 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 FBXL5Q9UKA1 691 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 GMEB2Q9UKD1 530 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 OAZ3Q9UMX2 235 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa4.84□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 PTPRBP23467 1997 aa4.84□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 IGF2RP11717 2491 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 K7ERI5 159 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 K7ESF4 209 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 SYN3O14994 580 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 HCRTO43612 131 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 TRAPPC3O43617 180 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 TBC1D4O60343 1298 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 ABLIM3O94929 683 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 MCF2P10911 925 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 TDGF1P13385 188 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 KCNE1P15382 129 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 CPEP16870 476 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 PTPN2P17706 415 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 TRAPPC10P48553 1259 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 RAC3P60763 192 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 ACAP1Q15027 740 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 IL17AQ16552 155 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 ZNF528Q3MIS6 628 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 CT83Q5H943 113 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 ZNF280DQ6N043 979 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 RINT1Q6NUQ1 792 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 ZNF852Q6ZMS4 543 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 GAREM2Q75VX8 874 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 RTL10Q7L3V2 364 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 KBTBD6Q86V97 674 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 FAM184AQ8NB25 1140 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 ATAD1Q8NBU5 361 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 ZBTB44Q8NCP5 570 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 ATL2Q8NHH9 583 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 FAM3CQ92520 227 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 DNASE1L2Q92874 299 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 ELSPBP1Q96BH3 223 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 LRRC37BQ96QE4 947 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 LMF1Q96S06 567 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CBX1P1-201ENST00000440184 DPYSL5Q9BPU6 564 aa4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms