RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455157.6

SSUH2-208, Transcript of ssu-2 homolog (C. elegans), human

TSL 2

Gene SSUH2, Length 3,219 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSUH2-208	ENST00000455157	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	ACAD9	Q9H845	621 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	THEG	Q9P2T0	379 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	APPL1	Q9UKG1	709 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	AK5	Q9Y6K8	562 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	NFASC	O94856	1347 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	CAPN8	A6NHC0	703 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	TPP1	O14773	563 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	ADCY6	O43306	1168 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	PEX10	O60683	326 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	FUCA1	P04066	466 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	PTPN7	P35236	360 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	NUDT2	P50583	147 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	CLDN10	P78369	228 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	TNS4	Q8IZW8	715 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	11.65	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	PEBP4	Q96S96	227 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	B4GALT5	O43286	388 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	RFPL1	O75677	317 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	RGS20	O76081	388 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	P4HA1	P13674	534 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	SERPINB9	P50453	376 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF132	P52740	706 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	EFNA5	P52803	228 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	SP2	Q02086	613 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	KCNJ11	Q14654	390 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	TBCC	Q15814	346 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	PPM1J	Q5JR12	505 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	HACE1	Q8IYU2	909 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	PLD5	Q8N7P1	536 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	BIRC8	Q96P09	236 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	TWNK	Q96RR1	684 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	CNTNAP1	P78357	1384 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157		A0A088AWK7	358 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157		H3BSA7	217 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	MGEA5	O60502	916 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	SIN3B	O75182	1162 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	POTEH	Q6S545	545 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	LZTR1	Q8N653	840 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	C12orf29	Q8N999	325 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	WRNIP1	Q96S55	665 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	METTL18	O95568	372 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	OCM2	P0CE71	109 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	RALB	P11234	206 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	PHKA2	P46019	1235 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	WASHC5	Q12768	1159 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	CYTH1	Q15438	398 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	TMC7	Q7Z402	723 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157		Q9H521	79 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	CAPN14	A8MX76	684 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	NFIC	P08651	508 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	TSHR	P16473	764 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	ASPA	P45381	313 aa		11.63	□□□□□ -0.55

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