RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 SENP7Q9BQF6 1050 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 SLC26A6Q9BXS9 759 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 AGXT2Q9BYV1 514 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 SYNPO2LQ9H987 977 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 SFXN1Q9H9B4 322 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 MTMR4Q9NYA4 1195 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 TBX20Q9UMR3 447 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 GDAQ9Y2T3 454 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 WNT6Q9Y6F9 365 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 UBE2Q2LH0YL09 131 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 PEX12O00623 359 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 CNTN5O94779 1100 aa3.46□□□□□ -1.86
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PTPRC-205ENST00000391970 RFPL3SP0C7P2 107 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 LYL1P12980 280 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 ATP1A3P13637 1013 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 TNFAIP3P21580 790 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 PRPH2P23942 346 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 ELF1P32519 619 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 NR1H2P55055 460 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 INHBCP55103 352 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 SHC2P98077 582 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 KLF10Q13118 480 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 FHL2Q14192 279 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 LIPMQ5VYY2 423 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 MAATS1Q7Z4T9 603 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 GGNQ86UU5 652 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 RFX6Q8HWS3 928 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 GALNT4Q8N4A0 578 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 TSPYL6Q8N831 410 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 EXD3Q8N9H8 876 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 STAMQ92783 540 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 ATP2A3Q93084 1043 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 SKA1Q96BD8 255 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 P2RY11Q96G91 374 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 MASTLQ96GX5 879 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 RITA1Q96K30 269 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 TRIM2Q9C040 744 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 NUAK2Q9H093 628 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 JMJD4Q9H9V9 463 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 THAP1Q9NVV9 213 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 CD207Q9UJ71 328 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 HSF4Q9ULV5 492 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 ANP32CO43423 234 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 MBD4O95243 580 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 METTL18O95568 372 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 CD4P01730 458 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 ENO1P06733 434 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
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PTPRC-205ENST00000391970 TGM2P21980 687 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 AVPR2P30518 371 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 IDUAP35475 653 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 KRT9P35527 623 aa3.45□□□□□ -1.86
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PTPRC-205ENST00000391970 ZXDAP98168 799 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 DPTQ07507 201 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
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PTPRC-205ENST00000391970 GXYLT1Q4G148 440 aa3.45□□□□□ -1.86
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PTPRC-205ENST00000391970 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa3.45□□□□□ -1.86
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PTPRC-205ENST00000391970 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 RANBP10Q6VN20 620 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 LRRC8DQ7L1W4 858 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 RTL10Q7L3V2 364 aa3.45□□□□□ -1.86
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PTPRC-205ENST00000391970 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 SCN4BQ8IWT1 228 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 TCP11L2Q8N4U5 519 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 GPR150Q8NGU9 434 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 ST8SIA4Q92187 359 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 KCNJ9Q92806 393 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-205ENST00000391970 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa3.45□□□□□ -1.86
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