RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612980.4

RDM1-215, Transcript of RAD52 motif containing 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene RDM1, Length 501 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RDM1-215	ENST00000612980	MON1B	Q7L1V2	547 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	RELL1	Q8IUW5	271 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	NAXD	Q8IW45	347 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	ATL2	Q8NHH9	583 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	TCP11	Q8WWU5	503 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	ZNF653	Q96CK0	615 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	PGM2	Q96G03	612 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	BTBD6	Q96KE9	485 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	FNBP1	Q96RU3	617 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	DPH5	Q9H2P9	285 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	WHRN	Q9P202	907 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	SNX24	Q9Y343	169 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	GMNC	A6NCL1	334 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	C5orf60	A6NFR6	353 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	EBAG9	O00559	213 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	NRP1	O14786	923 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	GPR182	O15218	404 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	OGT	O15294	1046 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	ADAM12	O43184	909 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	TRAPPC3	O43617	180 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	SPOP	O43791	374 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	DIAPH2	O60879	1101 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	TOM1L1	O75674	476 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	GJB3	O75712	270 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	TCEA3	O75764	348 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	EFEMP2	O95967	443 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	CLTA	P09496	248 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	NDUFV2	P19404	249 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	MMP8	P22894	467 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	RRM1	P23921	792 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	MAN1A1	P33908	653 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	KCNJ1	P48048	391 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	ACOT2	P49753	483 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	SLC26A2	P50443	739 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	PLTP	P55058	493 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	PPP2R2A	P63151	447 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	NOMO3	P69849	1222 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	RHD	Q02161	417 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	CAV1	Q03135	178 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	CBLB	Q13191	982 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	CAPS	Q13938	189 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	SLC29A2	Q14542	456 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	MAPK6	Q16659	721 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	CCDC157	Q569K6	752 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	LIN9	Q5TKA1	542 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	LRRC38	Q5VT99	294 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	NAA35	Q5VZE5	725 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	WDR49	Q8IV35	697 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RDM1-215	ENST00000612980	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		4.98	□□□□□ -1.61

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