RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 E9PLN8 166 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRIAP1O43715 76 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 DDAH1O94760 285 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 HAUS5O94927 633 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 FESP07332 822 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 NR1D1P20393 614 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 LPOP22079 712 aaPredicted RBP-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 NASPP49321 788 aaPredicted RBP-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRTAP12-3P60328 96 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 HSF1Q00613 529 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 STIM1Q13586 685 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 Q5PR19 223 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 DACT2Q5SW24 774 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARHGAP17Q68EM7 881 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM166AQ6J272 317 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLIP4Q8N3C7 705 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGSF22Q8N9C0 903 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 SH3TC2Q8TF17 1288 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 KLHL29Q96CT2 875 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 FOXN4Q96NZ1 517 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 CTRCQ99895 268 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 VKORC1Q9BQB6 163 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 SCNM1Q9BWG6 230 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 DCLK3Q9C098 648 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 LDAHQ9H6V9 325 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 CELA1Q9UNI1 258 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 NOTCH1P46531 2555 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 KLHL33A6NCF5 533 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 PHGR1C9JFL3 82 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 WDR47O94967 919 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 NFATC1O95644 943 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC9A1P19634 815 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 SWSAP1Q6NVH7 229 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 CDC20BQ86Y33 519 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 ERC1Q8IUD2 1116 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC82Q8N4S0 544 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 GSTCDQ8NEC7 633 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMIEQ8NEW7 156 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 ABHD11Q8NFV4 315 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM76AQ8TAV0 307 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 SCLYQ96I15 445 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 PCIF1Q9H4Z3 704 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 FZD3Q9NPG1 666 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 HIF1ANQ9NWT6 349 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 ETAA1Q9NY74 926 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 NUMBLQ9Y6R0 609 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 PHF2O75151 1096 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 FOXH1O75593 365 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 GCATO75600 419 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 TCEA3O75764 348 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 ECHS1P30084 290 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATP8B2P98198 1209 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 PSG6Q00889 435 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRAF3Q13114 568 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 MTM1Q13496 603 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 CNGA3Q16281 694 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 CYP1B1Q16678 543 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 FLYWCH1Q4VC44 716 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 ADIPOR2Q86V24 386 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM217AQ8IXS0 508 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 LINC01465Q8N7H1 131 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC44A5Q8NCS7 719 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPATA32Q96LK8 384 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRIB1Q96RU8 372 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 EPYCQ99645 322 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 WDR13Q9H1Z4 485 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC52A2Q9HAB3 445 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 ACTR10Q9NZ32 417 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 STRIP2Q9ULQ0 834 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 TCF19Q9Y242 345 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 CDY2AQ9Y6F7 541 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A1B0GVT2 93 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 LCHNA4D1U4 455 aa-0.17□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.1 ms