RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 IRGQQ8WZA9 623 aa10.44□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 PPP2R3CQ969Q6 453 aa10.44□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 SLAIN2Q9P270 581 aa10.44□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 BTAF1O14981 1849 aa10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 ADRA1DP25100 572 aa10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 PRELPP51888 382 aa10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 XIAPP98170 497 aa10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 ARHGAP24Q8N264 748 aa10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 TRIM55Q9BYV6 548 aa10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 C1orf21Q9H246 121 aa10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 MANSC1Q9H8J5 431 aa10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 NYAP2Q9P242 653 aa10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 CIDEBQ9UHD4 219 aa10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 CREB3O43889 395 aa10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 EIF6P56537 245 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 SESN3P58005 492 aa10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 SLC18A2Q05940 514 aa10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 OASLQ15646 514 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 AAGABQ6PD74 315 aa10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 PDSS2Q86YH6 399 aa10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 PANX3Q96QZ0 392 aa10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 NACC1Q96RE7 527 aa10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 CENPKQ9BS16 269 aa10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 STRIP2Q9ULQ0 834 aa10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 WDR81Q562E7 1941 aa10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 TM7SF2O76062 418 aa10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 GTF2H1P32780 548 aa10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 GCLMP48507 274 aa10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 MXI1P50539 228 aa10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 GTF2BQ00403 316 aa10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 CDC16Q13042 620 aa10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 MYBPC3Q14896 1274 aa10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 TMPRSS6Q8IU80 811 aa10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 GLIS1Q8NBF1 620 aa10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 AMNQ9BXJ7 453 aa10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 ACSS3Q9H6R3 686 aa10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 ACP6Q9NPH0 428 aa10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 SERPINB13Q9UIV8 391 aa10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa10.43□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 COQ9O75208 318 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 ADRB2P07550 413 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 KRT4P19013 534 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 SERPINB3P29508 390 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 CETN2P41208 172 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 ARFIP2P53365 341 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 ODR4Q5SWX8 454 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 CYP4F22Q6NT55 531 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 RHOT1Q8IXI2 618 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 STMN2Q93045 179 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 HSPBP1Q9NZL4 362 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 ZBTB39O15060 712 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 BMP3P12645 472 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 KRT15P19012 456 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 TAS2R40P59535 323 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 NFIXQ14938 502 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 NCAPG2Q86XI2 1143 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 XXYLT1Q8NBI6 393 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 CYP2W1Q8TAV3 490 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 NAT14Q8WUY8 206 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 LZICQ8WZA0 190 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 GMCL1Q96IK5 515 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 ACCSQ96QU6 501 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 TSSK1BQ9BXA7 367 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 MIS12Q9H081 205 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 TMEM8AQ9HCN3 771 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 DENND3A2RUS2 1198 aa10.41□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 ITGAVP06756 1048 aa10.41□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 GRIA2P42262 883 aa10.41□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 GPSM2P81274 684 aa10.41□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 GCNT1Q02742 428 aa10.41□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 CREB5Q02930 508 aa10.41□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 TBCCQ15814 346 aa10.41□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa10.41□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 TCP10LQ8TDR4 215 aa10.41□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 CCDC17Q96LX7 622 aa10.41□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa10.41□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 KCNQ5Q9NR82 932 aa10.41□□□□□ -0.74
HCG18-242ENST00000602319 KCNK4Q9NYG8 393 aa10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105 ms