RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 HOMER3Q9NSC5 361 aa3.84□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 CYP39A1Q9NYL5 469 aa3.84□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 E7ENQ6 273 aa3.84□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP2A1O14983 1001 aa3.84□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 NPTXRO95502 500 aa3.84□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ETS1P14921 441 aa3.84□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
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PGGT1B-203ENST00000419445 PPP1R7Q15435 360 aa3.84□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 USH1GQ495M9 461 aa3.84□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 DENND2CQ68D51 928 aa3.84□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa3.84□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 CPLX4Q7Z7G2 160 aa3.84□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa3.84□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 SAAL1Q96ER3 474 aa3.84□□□□□ -1.79
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PGGT1B-203ENST00000419445 PI4K2AQ9BTU6 479 aa3.84□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 BATF3Q9NR55 127 aa3.84□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC17A7Q9P2U7 560 aa3.84□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC16A4O15374 487 aa3.84□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 PSTPIP1O43586 416 aa3.84□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 GAS7O60861 476 aa3.84□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 SNNO75324 88 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 PRKCHP24723 683 aa3.84□□□□□ -1.79
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PGGT1B-203ENST00000419445 I6L893 689 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 EPHB2P29323 1055 aa3.84□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 USP8P40818 1118 aa3.84□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 GRIA2P42262 883 aa3.84□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 RAP1GDS1P52306 607 aa3.84□□□□□ -1.79
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PGGT1B-203ENST00000419445 FMNL3Q8IVF7 1028 aa3.84□□□□□ -1.79
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PGGT1B-203ENST00000419445 SERAC1Q96JX3 654 aa3.84□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 TGDSO95455 350 aa3.84□□□□□ -1.8
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PGGT1B-203ENST00000419445 WEE2P0C1S8 567 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CYP3A5P20815 502 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 EDNRBP24530 442 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 L1CAMP32004 1257 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ARL2P36404 184 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MAGEA4P43358 317 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.8
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PGGT1B-203ENST00000419445 NR1H3Q13133 447 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNJ11Q14654 390 aa3.84□□□□□ -1.8
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PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF653Q96CK0 615 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC113Q9H0I3 377 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM206Q9H813 350 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PNPLA8Q9NP80 782 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 GJD2Q9UKL4 321 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 EMCNQ9ULC0 261 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 USP3Q9Y6I4 520 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TEX264Q9Y6I9 313 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TLDC2A0PJX2 215 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 BANF1O75531 89 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TCP10Q12799 353 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 STAT4Q14765 748 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CYHR1Q6ZMK1 362 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 BNIPLQ7Z465 357 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SEPT12Q8IYM1 358 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ACTL9Q8TC94 416 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF606Q8WXB4 792 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ETNK1Q9HBU6 452 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ARL8BQ9NVJ2 186 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC24A2Q9UI40 661 aa3.84□□□□□ -1.8
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PGGT1B-203ENST00000419445 ANK1P16157 1881 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 DPPA5A6NC42 116 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ITGAVP06756 1048 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 KRT10P13645 584 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TNFAIP3P21580 790 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC1A1P43005 524 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CNTN2Q02246 1040 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 DGKZQ13574 1117 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 USP41Q3LFD5 358 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM83AQ86UY5 434 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 FAF2Q96CS3 445 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SIGLEC10Q96LC7 697 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 VRTNQ9H8Y1 702 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 POPDC2Q9HBU9 364 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ACTR3P61158 418 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PKDCCQ504Y2 493 aa3.83□□□□□ -1.8
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