RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAD54LQ92698 747 aa28.53■■■□□ 2.16
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYP4F11Q9HBI6 524 aa28.53■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCDHB8Q9UN66 801 aa28.53■■■□□ 2.16
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYH15Q9Y2K3 1946 aa28.53■■■□□ 2.16
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KXD1Q9BQD3 176 aa28.51■■■□□ 2.15
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INSL5Q9Y5Q6 135 aa28.5■■■□□ 2.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LACTBL1A8MY62 500 aa28.49■■■□□ 2.15
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPECC1Q5M775 1068 aa28.49■■■□□ 2.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa28.49■■■□□ 2.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASCL5Q7RTU5 278 aa28.49■■■□□ 2.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CORO1BQ9BR76 489 aa28.49■■■□□ 2.15
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAFFQ9ULX9 164 aa28.49■■■□□ 2.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRR23AA6NEV1 266 aa28.48■■■□□ 2.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 M0QZQ0 153 aa28.48■■■□□ 2.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM189A1O60320 539 aa28.48■■■□□ 2.15
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADCY1Q08828 1119 aa28.48■■■□□ 2.15
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCSER1Q9C0I3 900 aa28.48■■■□□ 2.15
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ELMOD1Q8N336 334 aa28.47■■■□□ 2.15
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF197O14709 1029 aa28.46■■■□□ 2.15
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADRB2P07550 413 aa28.46■■■□□ 2.15
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC39A4Q6P5W5 647 aa28.46■■■□□ 2.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAP4K3Q8IVH8 894 aa28.46■■■□□ 2.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PJA1Q8NG27 643 aa28.46■■■□□ 2.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM212AQ96EL1 285 aa28.46■■■□□ 2.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FIZ1Q96SL8 496 aa28.46■■■□□ 2.15
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRKCQQ04759 706 aa28.45■■■□□ 2.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC44A4Q53GD3 710 aa28.45■■■□□ 2.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRSS36Q5K4E3 855 aa28.45■■■□□ 2.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IQCEQ6IPM2 695 aa28.45■■■□□ 2.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DSTYKQ6XUX3 929 aa28.45■■■□□ 2.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa28.45■■■□□ 2.14
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP37Q86T82 979 aa28.45■■■□□ 2.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD302Q8IX05 232 aa28.45■■■□□ 2.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EPSTI1Q96J88 318 aa28.45■■■□□ 2.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa28.45■■■□□ 2.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TWF1Q12792 350 aa28.44■■■□□ 2.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTPAQ15257 358 aa28.44■■■□□ 2.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYP4A22Q5TCH4 519 aa28.44■■■□□ 2.14
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