RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 TRAIPQ9BWF2 469 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 MTFR1LQ9H019 292 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 HPCAL4Q9UM19 191 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 CFLARO15519 480 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 RAD51CO43502 376 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 RUBCNQ92622 972 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 GBP5Q96PP8 586 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 DCTN3O75935 186 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 DGKDQ16760 1214 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 ANKMY2Q8IV38 441 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 Q9H521 79 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 DUSP10Q9Y6W6 482 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 KCNN4O15554 427 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 ZWINTO95229 277 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 PGK2P07205 417 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 KCNJ1P48048 391 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 SYCP2LQ5T4T6 812 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 CEP120Q8N960 986 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 C9orf72Q96LT7 481 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC13A1Q9BZW2 595 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 EPS15L1Q9UBC2 864 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 AKAP3O75969 853 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 GNASQ5JWF2 1037 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 VCX3AQ9NNX9 186 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 RPS6KA5O75582 802 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 CYP2C19P33261 490 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 OCRLQ01968 901 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 P3H1Q32P28 736 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 FIGNQ5HY92 759 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF720Q7Z2F6 126 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 USP38Q8NB14 1042 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM118BQ9BPY3 351 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 IDI2Q9BXS1 227 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 THAP2Q9H0W7 228 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 DCTN4Q9UJW0 460 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 ART3Q13508 389 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 SH2D3CQ8N5H7 860 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 EPAS1Q99814 870 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 APRTP07741 180 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 TAC1P20366 129 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 MX2P20592 715 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 CARSP49589 748 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 ZFPM1Q8IX07 1006 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 CELF2O95319 508 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 CD4P01730 458 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 GRIK5Q16478 980 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 JAMLQ86YT9 394 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 HPDLQ96IR7 371 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 GTF3C4Q9UKN8 822 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 GAS2O43903 313 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 HSD17B4P51659 736 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 PMS1P54277 932 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF677Q86XU0 584 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 AKT1S1Q96B36 256 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 ADAM33Q9BZ11 813 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 SP110Q9HB58 689 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 WNT10BO00744 389 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 TRAPPC3O43617 180 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 SPAG7O75391 227 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 BRD2P25440 801 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 CLCN3P51790 818 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 TPI1P60174 286 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 GUCY1A3Q02108 690 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 STAT4Q14765 748 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 PCNX4Q63HM2 1172 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 OR6P1Q8NGX9 317 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 TRIM62Q9BVG3 475 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 MAGEB5Q9BZ81 275 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 PXMP2Q9NR77 195 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 OGTO15294 1046 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 RPSAP08865 295 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 SULT1E1P49888 294 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 PARD3BQ8TEW8 1205 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 SDCCAG3Q96C92 435 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 ABCF3Q9NUQ8 709 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 EHD2Q9NZN4 543 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 INTUQ9ULD6 942 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 ZBBXA8MT70 800 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 ITIH2P19823 946 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 COPS2P61201 443 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 LACRTQ9GZZ8 138 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 RAB6BQ9NRW1 208 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-208ENST00000615445 ATP9BO43861 1147 aa21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms