RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384139.1

RNU6-187P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 187, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-187P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-187P-201ENST00000384139 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 RFX6Q8HWS3 928 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 PCIF1Q9H4Z3 704 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 COQ6Q9Y2Z9 468 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 CRTAMO95727 393 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 TTLL1O95922 423 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP2.42□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 ARHGAP25P42331 645 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 PTPRRQ15256 657 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 EPHA7Q15375 998 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 KIAA1841Q6NSI8 718 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 C7orf31Q8N865 590 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 CDYL2Q8N8U2 506 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 PGBD1Q96JS3 809 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 EXOC2Q96KP1 924 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 PODXL2Q9NZ53 605 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRKAG3Q9UGI9 489 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 SERGEFQ9UGK8 458 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 C4orf47A7E2U8 309 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 LINC01565O15544 149 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 NPTXRO95502 500 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 FLT3LGP49771 235 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 NRG3P56975 720 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP2.41□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 ARHGAP44Q17R89 818 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF585BQ52M93 769 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 BSPRYQ5W0U4 402 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 LMBR1LQ6UX01 489 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 OVCH1Q7RTY7 1134 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 MCF2L2Q86YR7 1114 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 DRC7Q8IY82 874 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 GALNT16Q8N428 558 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 BACH2Q9BYV9 841 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 GSTO2Q9H4Y5 243 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 GJB4Q9NTQ9 266 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 MRVI1Q9Y6F6 885 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 AATKQ6ZMQ8 1374 aa2.4□□□□□ -2.02
RNU6-187P-201ENST00000384139 LACTBL1A8MY62 500 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 ADM5C9JUS6 153 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 KRT37O76014 449 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 JTBO76095 146 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 URI1O94763 535 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 GASTP01350 101 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP2.4□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 GCSHP23434 173 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 KRTAP10-3P60369 221 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 GEN1Q17RS7 908 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 Q4G0T1 1027 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 CEP85Q6P2H3 762 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 SHC4Q6S5L8 630 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 MDM1Q8TC05 714 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 CDC6Q99741 560 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 MCM8Q9UJA3 840 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 TXNRD1Q16881 649 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 OTOP1Q7RTM1 612 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 CUZD1Q86UP6 607 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 LILRB2Q8N423 598 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 C16orf52Q8NHV5 167 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 MED15Q96RN5 788 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 USP25Q9UHP3 1055 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM83GA6ND36 823 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 IFITM10A6NMD0 228 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 TISP43B9A030 160 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRRT4C9JH25 899 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 E5RJQ4 531 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 H3BNX3 289 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 MYO1FO00160 1098 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 TBC1D4O60343 1298 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRAMEF4O60810 478 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 ITGA10O75578 1167 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 PCDH8O95206 1070 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 CRYABP02511 175 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 CHRM2P08172 466 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 DRD4P21917 467 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 KCNJ5P48544 419 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-187P-201ENST00000384139 CCT8P50990 548 aa2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms