RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591126.5

SMAD4-212, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMAD4, Length 4,970 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-212ENST00000591126 MCM6Q14566 821 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 TMED2Q15363 201 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 NOMO2Q5JPE7 1267 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 MAATS1Q7Z4T9 603 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 FAM213AQ9BRX8 229 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 CENPKQ9BS16 269 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 TRIM54Q9BYV2 358 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 ASAH2Q9NR71 780 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 KIAA1468Q9P260 1216 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 CTAGE15A4D2H0 777 aa6.7□□□□□ -1.34
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SMAD4-212ENST00000591126 ZMYND10O75800 440 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 CTAGE8P0CG41 777 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 VAV2P52735 878 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 C4orf22Q6V702 233 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 PEX26Q7Z412 305 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 CTAGE6Q86UF2 777 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 VSIG10LQ86VR7 867 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 CTAGE4Q8IX94 777 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 KIRREL3Q8IZU9 778 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 IFT43Q96FT9 208 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 TMEM134Q9H6X4 195 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 SP110Q9HB58 689 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 KCTD5Q9NXV2 234 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 DERAQ9Y315 318 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 ATRNL1Q5VV63 1379 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 CCDC151A5D8V7 595 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 B3GAT3O94766 335 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 NR3C1P04150 777 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 RENBPP51606 427 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 RPS6KA1Q15418 735 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 SLC24A5Q71RS6 500 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 PPP1R16AQ96I34 528 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 PPP1R16BQ96T49 567 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 ELOVL4Q9GZR5 314 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 USTQ9Y2C2 406 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 MYO5BQ9ULV0 1848 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 CLUHO75153 1309 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 JAK2O60674 1132 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 PRMT3O60678 531 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 ARHGEF7Q14155 803 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 ACCSLQ4AC99 568 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 CYB5R4Q7L1T6 521 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 RASGRP4Q8TDF6 673 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 PGBD1Q96JS3 809 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 PTPN22Q9Y2R2 807 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 TEAD4Q15561 434 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 EDRF1Q3B7T1 1238 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 SMYD5Q6GMV2 418 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 GDAP1Q8TB36 358 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 ARHGEF26Q96DR7 871 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 ZWILCHQ9H900 591 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 RGL1Q9NZL6 768 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF112Q9UJU3 913 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 RCOR1Q9UKL0 485 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 ASB3Q9Y575 518 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 GOLGA8JA6NMD2 632 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 GOLGA8MH3BSY2 632 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 M0QYT0 321 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 SGPL1O95470 568 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 ICAM3P32942 547 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 DNA2P51530 1060 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 TRIM58Q8NG06 486 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 VPS39Q96JC1 886 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 MAML3Q96JK9 1138 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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