RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 SPIRE1Q08AE8 756 aa26.89■■□□□ 1.9
SMKR1-201ENST00000462322 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
SMKR1-201ENST00000462322 SPRED2Q7Z698 418 aa26.89■■□□□ 1.9
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM40Q8WWA1 233 aa26.89■■□□□ 1.9
SMKR1-201ENST00000462322 OSMRQ99650 979 aa26.89■■□□□ 1.9
SMKR1-201ENST00000462322 KIF3AQ9Y496 699 aa26.89■■□□□ 1.9
SMKR1-201ENST00000462322 LINC01553A4QN01 128 aa26.88■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 RFXAPO00287 272 aa26.88■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 GPR32O75388 356 aa26.88■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 TXKP42681 527 aa26.88■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 ODR4Q5SWX8 454 aa26.88■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 ANO5Q75V66 913 aa26.88■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 LINC01599Q8WXQ3 324 aa26.88■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 LXNQ9BS40 222 aa26.88■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 BACH2Q9BYV9 841 aa26.88■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 RGL1Q9NZL6 768 aa26.88■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 EPOPA6NHQ4 379 aa26.87■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 PLA2G4FQ68DD2 849 aa26.87■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 NOSTRINQ8IVI9 506 aa26.87■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF710Q8N1W2 664 aa26.87■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 DYDC2Q96IM9 177 aa26.87■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 MTMR9Q96QG7 549 aa26.87■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 CEP89Q96ST8 783 aa26.87■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 ERVK-5Q9HDB9 667 aa26.87■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 MTUS1Q9ULD2 1270 aa26.87■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 GPR182O15218 404 aa26.86■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 CYP4A11Q02928 519 aa26.86■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 SCLT1Q96NL6 688 aa26.86■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM60Q9H2L4 133 aa26.86■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 TMX1Q9H3N1 280 aa26.86■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa26.86■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa26.86■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 DNM2P50570 870 aa26.85■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 ERVK-21P61565 698 aa26.85■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF174Q15697 407 aa26.85■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 C4orf19Q8IY42 314 aa26.85■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 PPM1EQ8WY54 764 aa26.85■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 ADAMTS10Q9H324 1103 aa26.85■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 CYP26B1Q9NR63 512 aa26.85■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.85■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 TTC3P53804 2025 aa26.84■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa26.84■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 MAFO75444 373 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 NPEPPSP55786 919 aa26.84■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 DRP2Q13474 957 aa26.84■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 TTC38Q5R3I4 469 aa26.84■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 TPH2Q8IWU9 490 aa26.84■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 CEP170P1Q96L14 293 aa26.84■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 TRANK1O15050 2925 aa26.84■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 SLITRK3O94933 977 aa26.83■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP26.83■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 GJB2P29033 226 aa26.83■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 YWHABP31946 246 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 TRAPPC10P48553 1259 aa26.83■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 GPC3P51654 580 aa26.83■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 OTUD6AQ7L8S5 288 aa26.83■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 FAM228AQ86W67 206 aa26.83■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 NLRP7Q8WX94 980 aa26.83■■□□□ 1.89
SMKR1-201ENST00000462322 DENND3A2RUS2 1198 aa26.82■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 MICALL1Q8N3F8 863 aa26.82■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 NEK9Q8TD19 979 aa26.82■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 SLC7A3Q8WY07 619 aa26.82■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 ADAM2Q99965 735 aa26.82■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 HSD17B14Q9BPX1 270 aa26.82■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 C17orf80Q9BSJ5 609 aa26.82■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 SMC3Q9UQE7 1217 aa26.82■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 PPME1Q9Y570 386 aa26.82■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 EYSQ5T1H1 3165 aa26.81■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 MGEA5O60502 916 aa26.81■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 OR52Z1P0C646 297 aa26.81■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 STAG3L1P0CL83 205 aa26.81■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 CDC42EP1Q00587 391 aa26.81■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 GRB10Q13322 594 aa26.81■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 NPAS4Q8IUM7 802 aa26.81■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 EXOC8Q8IYI6 725 aa26.81■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 FIBCD1Q8N539 461 aa26.81■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 POTEMA6NI47 508 aa26.8■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 RFC5P40937 340 aa26.8■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 XKR9Q5GH70 373 aa26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59 ms