RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 KCNA1Q09470 495 aa19.76■□□□□ 0.75
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ACTB-201ENST00000331789 EDRF1Q3B7T1 1238 aa19.76■□□□□ 0.75
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ACTB-201ENST00000331789 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
ACTB-201ENST00000331789 MAF1Q9H063 256 aa19.72■□□□□ 0.75
ACTB-201ENST00000331789 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
ACTB-201ENST00000331789 MMRN2Q9H8L6 949 aa19.72■□□□□ 0.75
ACTB-201ENST00000331789 SEL1LQ9UBV2 794 aa19.72■□□□□ 0.75
ACTB-201ENST00000331789 KCNH4Q9UQ05 1017 aa19.72■□□□□ 0.75
ACTB-201ENST00000331789 SCN4AP35499 1836 aa19.72■□□□□ 0.75
ACTB-201ENST00000331789 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-201ENST00000331789 A0A0U1RQJ8 604 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-201ENST00000331789 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP19.71■□□□□ 0.75
ACTB-201ENST00000331789 TGFB1I1O43294 461 aa19.71■□□□□ 0.75
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