RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389993.7

PSME4-201, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PSME4, Length 6,581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-201ENST00000389993 ANKRD42Q8N9B4 389 aa15.96■□□□□ 0.15
PSME4-201ENST00000389993 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PSME4-201ENST00000389993 GCNT4Q9P109 453 aa15.96■□□□□ 0.15
PSME4-201ENST00000389993 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa15.96■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 GOLGA8SH3BPF8 625 aa15.95■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 DEFB132Q7Z7B7 95 aa15.95■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 AK9Q5TCS8 1911 aa15.95■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 MEGF6O75095 1541 aa15.95■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 DYNLT1P63172 113 aa15.95■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 CERKQ8TCT0 537 aa15.95■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 THAP12O43422 761 aa15.95■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 GNA14O95837 355 aa15.95■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 NBPF11Q86T75 865 aa15.95■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 DYDC2Q96IM9 177 aa15.95■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 SLC7A5Q01650 507 aa15.95■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 DDX12PQ92771 950 aa15.95■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 ABCC12Q96J65 1359 aa15.95■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 C7orf31Q8N865 590 aa15.95■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 GSDMAQ96QA5 445 aa15.95■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 F5H6K3 240 aa15.94■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 NTSR2O95665 410 aa15.94■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 ARPP19P56211 112 aa15.94■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 KLRC3Q07444 240 aa15.94■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 PDXDC2PQ6P474 469 aa15.94■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 CYFIP1Q7L576 1253 aa15.94■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 C10orf67Q8IYJ2 551 aa15.94■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 KRT12Q99456 494 aa15.94■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 TNNC2P02585 160 aa15.94■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa15.94■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 TMEM179Q6ZVK1 233 aa15.94■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 IFT20Q8IY31 132 aa15.94■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 VPS37BQ9H9H4 285 aa15.94■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 ZBTB5O15062 677 aa15.94■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 PRCPP42785 496 aa15.94■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 GABPAQ06546 454 aa15.94■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa15.94■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 ZNF653Q96CK0 615 aa15.94■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 SLC10A4Q96EP9 437 aa15.94■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 IQSEC2Q5JU85 1478 aa15.94■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 FCER1AP12319 257 aa15.94■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 KRT31Q15323 416 aa15.94■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 KRT26Q7Z3Y9 468 aa15.94■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 AFAP1L1Q8TED9 768 aa15.94■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 BEGAINQ9BUH8 593 aa15.94■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 STK24Q9Y6E0 443 aa15.94■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 PXDNQ92626 1479 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 GOLGA6CA6NDK9 693 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 GOLGA6BA6NDN3 693 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 GOLGA6DP0CG33 693 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 QRICH1Q2TAL8 776 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 RMDN3Q96TC7 470 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 KRT81Q14533 505 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 SHC4Q6S5L8 630 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 TRIML1Q8N9V2 468 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 FOSP01100 380 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 CCDC89Q8N998 374 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 ZMYND15Q9H091 742 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 SRGAP2O75044 1071 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 SAT1P21673 171 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 KCTD16Q68DU8 428 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 FBF1Q8TES7 1133 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 KAZALD1Q96I82 304 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 NRBP2Q9NSY0 501 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 ATXN8OSP0DMR3 200 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 OSBPP22059 807 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 GPATCH11Q8N954 259 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 OGFRQ9NZT2 677 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa15.93■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 AFPP02771 609 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 C3orf67Q6ZVT6 689 aa15.92■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 PASD1Q8IV76 773 aa15.92■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 DLC1Q96QB1 1528 aa15.92■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 TCP11X2Q5H9J9 407 aa15.92■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 SLC7A3Q8WY07 619 aa15.92■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 GEN1Q17RS7 908 aa15.92■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 STAM2O75886 525 aa15.92■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 MTMR1Q13613 665 aa15.92■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 SFR1Q86XK3 245 aa15.92■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 HAUS1Q96CS2 278 aa15.92■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 USP14P54578 494 aa15.91■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 CCDC6Q16204 474 aa15.91■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 FAM160B1Q5W0V3 765 aa15.91■□□□□ 0.14
PSME4-201ENST00000389993 TMC4Q7Z404 712 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.6 ms