RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 KMT5BQ4FZB7 885 aa22.67■■□□□ 1.22
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PTPRJ-208ENST00000615445 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
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PTPRJ-208ENST00000615445 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC35F6Q8N357 371 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRJ-208ENST00000615445 RAB17Q9H0T7 212 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM184BQ9ULE4 1060 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRJ-208ENST00000615445 MAIP1Q8WWC4 291 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRJ-208ENST00000615445 SMC6Q96SB8 1091 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRJ-208ENST00000615445 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.66■■□□□ 1.22
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PTPRJ-208ENST00000615445 KRT71Q3SY84 523 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM160B2Q86V87 743 aa22.66■■□□□ 1.22
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PTPRJ-208ENST00000615445 FAM160B1Q5W0V3 765 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRJ-208ENST00000615445 CEP170P1Q96L14 293 aa22.65■■□□□ 1.22
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PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.64■■□□□ 1.21
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PTPRJ-208ENST00000615445 HACE1Q8IYU2 909 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 BHMT2Q9H2M3 363 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 CDC23Q9UJX2 597 aa22.64■■□□□ 1.21
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PTPRJ-208ENST00000615445 SEPT2Q15019 361 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 RNF169Q8NCN4 708 aa22.63■■□□□ 1.21
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PTPRJ-208ENST00000615445 USP17L15C9J2P7 530 aa22.62■■□□□ 1.21
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PTPRJ-208ENST00000615445 USP17L22D6RA61 530 aa22.62■■□□□ 1.21
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PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 DPP9Q86TI2 863 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 POTEMA6NI47 508 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 ALDH3A1P30838 453 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 NSFP46459 744 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 THAP9Q9H5L6 903 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 LRRN2O75325 713 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
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