RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540708.5

ARL6IP4-218, Transcript of ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 4, human

TSL 2

Gene ARL6IP4, Length 1,782 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARL6IP4-218	ENST00000540708	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	MSH4	O15457	936 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	CDC25B	P30305	580 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	OAZ1	P54368	228 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	KCNB1	Q14721	858 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	SV2B	Q7L1I2	683 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	STK24	Q9Y6E0	443 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	SCN4A	P35499	1836 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	HYI	Q5T013	277 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	UIMC1	Q96RL1	719 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	MYPN	Q86TC9	1320 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	OTOF	Q9HC10	1997 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	27.86	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	REPS2	Q8NFH8	660 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	RAD54L	Q92698	747 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	TRIM9	Q9C026	710 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	RLF	Q13129	1914 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	WDR90	Q96KV7	1748 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	UBXN2A	P68543	259 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	DRC7	Q8IY82	874 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	ERMN	Q8TAM6	284 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	WNK4	Q96J92	1243 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	RPTOR	Q8N122	1335 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		27.84	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	KLRC4	O43908	158 aa		27.84	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	CEP55	Q53EZ4	464 aa		27.84	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	SPC24	Q8NBT2	197 aa		27.84	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	FANCL	Q9NW38	375 aa		27.84	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	ESPN	B1AK53	854 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	PPAT	Q06203	517 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	COL20A1	Q9P218	1284 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	RHOBTB3	O94955	611 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	STAT3	P40763	770 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	MCM6	Q14566	821 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	ERO1B	Q86YB8	467 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	ELP3	Q9H9T3	547 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	RNF146	Q9NTX7	359 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-218	ENST00000540708	ATP2A1	O14983	1001 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ARL6IP4-218	ENST00000540708	TPM3	P06753	285 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ARL6IP4-218	ENST00000540708	ASIC1	P78348	528 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ARL6IP4-218	ENST00000540708	ECM1	Q16610	540 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ARL6IP4-218	ENST00000540708	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ARL6IP4-218	ENST00000540708	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
ARL6IP4-218	ENST00000540708	VAV3	Q9UKW4	847 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ARL6IP4-218	ENST00000540708	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ARL6IP4-218	ENST00000540708	MEIS1	O00470	390 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ARL6IP4-218	ENST00000540708	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
ARL6IP4-218	ENST00000540708	FANCC	Q00597	558 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ARL6IP4-218	ENST00000540708	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
ARL6IP4-218	ENST00000540708	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ARL6IP4-218	ENST00000540708	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
ARL6IP4-218	ENST00000540708	POTEC	B2RU33	542 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ARL6IP4-218	ENST00000540708	TKFC	Q3LXA3	575 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ARL6IP4-218	ENST00000540708	SPATA1	Q5VX52	437 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ARL6IP4-218	ENST00000540708	KCNK18	Q7Z418	384 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ARL6IP4-218	ENST00000540708	SLC5A5	Q92911	643 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ARL6IP4-218	ENST00000540708	MED15	Q96RN5	788 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ARL6IP4-218	ENST00000540708	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ARL6IP4-218	ENST00000540708	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ARL6IP4-218	ENST00000540708	EXOC1	Q9NV70	894 aa		27.81	■■■□□ 2.04

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