RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 CHPF2Q9P2E5 772 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF521Q96K83 1311 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF236Q9UL36 1845 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 MYH2Q9UKX2 1941 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 MYO7AQ13402 2215 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
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ECHDC1-211ENST00000460558 PGBD3Q8N328 593 aa5.1□□□□□ -1.59
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ECHDC1-211ENST00000460558 ZDHHC15Q96MV8 337 aa5.1□□□□□ -1.59
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ECHDC1-211ENST00000460558 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa5.1□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
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ECHDC1-211ENST00000460558 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM86C1Q9NVL1 165 aa5.1□□□□□ -1.59
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ECHDC1-211ENST00000460558 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
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ECHDC1-211ENST00000460558 COL4A6Q14031 1691 aa5.09□□□□□ -1.59
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ECHDC1-211ENST00000460558 USP17L7P0C7H9 530 aa5.09□□□□□ -1.59
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ECHDC1-211ENST00000460558 CCSER2Q9H7U1 834 aa5.09□□□□□ -1.59
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ECHDC1-211ENST00000460558 SIP14410 1827 aa5.09□□□□□ -1.6
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF536O15090 1300 aa5.08□□□□□ -1.6
ECHDC1-211ENST00000460558 A0A1W2PP55 124 aa5.08□□□□□ -1.6
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ECHDC1-211ENST00000460558 TAF5LO75529 589 aa5.08□□□□□ -1.6
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ECHDC1-211ENST00000460558 IL9P15248 144 aa5.08□□□□□ -1.6
ECHDC1-211ENST00000460558 CSF2RAP15509 400 aa5.08□□□□□ -1.6
ECHDC1-211ENST00000460558 CES1P23141 567 aa5.08□□□□□ -1.6
ECHDC1-211ENST00000460558 ITGA6P23229 1130 aa5.08□□□□□ -1.6
ECHDC1-211ENST00000460558 GSTT1P30711 240 aa5.08□□□□□ -1.6
ECHDC1-211ENST00000460558 MAP3K10Q02779 954 aa5.08□□□□□ -1.6
ECHDC1-211ENST00000460558 FAAP100Q0VG06 881 aa5.08□□□□□ -1.6
ECHDC1-211ENST00000460558 TCP10Q12799 353 aa5.08□□□□□ -1.6
ECHDC1-211ENST00000460558 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
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