RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623935.1

SOX9-AS1-217, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 1,563 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CREBZFQ9NS37 354 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 HOMER2Q9NSB8 354 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 FBXO40Q9UH90 709 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PCDHA6Q9UN73 950 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PARP14Q460N5 1801 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 POTEB2H3BUK9 544 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 BMP15O95972 392 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 APLP1P51693 650 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 GRM1Q13255 1194 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 MOGSQ13724 837 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TMEM132BQ14DG7 1078 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 FAM173BQ6P4H8 233 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 BRI3BPQ8WY22 251 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SPATA32Q96LK8 384 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PAGR1Q9BTK6 254 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 MAF1Q9H063 256 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ZNF536O15090 1300 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 BTBD19C9JJ37 291 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PIK3CDO00329 1044 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 FIBPO43427 364 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SLC25A27O95847 323 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ATP2B1P20020 1258 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CCNA1P78396 465 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 STK38Q15208 465 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 NPY5RQ15761 445 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 DEFB115Q30KQ5 88 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 USP17L6PQ6QN14 398 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PLCD3Q8N3E9 789 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 JMYQ8N9B5 988 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CHST13Q8NET6 341 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 RASGRP4Q8TDF6 673 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SHISA4Q96DD7 197 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SPATC1LQ9H0A9 340 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ACAD9Q9H845 621 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 RNF146Q9NTX7 359 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 POLR3EQ9NVU0 708 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CNPY2Q9Y2B0 182 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 MYH15Q9Y2K3 1946 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 RLFQ13129 1914 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 M0R2N6 131 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CYP2C8P10632 490 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 NOGQ13253 232 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 UBE2SQ16763 222 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TTC38Q5R3I4 469 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ANO1Q5XXA6 986 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 NSMFQ6X4W1 530 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 RNF207Q6ZRF8 634 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 NEK8Q86SG6 692 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 NCAPG2Q86XI2 1143 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 RIOX2Q8IUF8 465 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 REPS2Q8NFH8 660 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 KCNG4Q8TDN1 519 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TBCKQ8TEA7 893 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TNFRSF25Q93038 417 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 RTEL1Q9NZ71 1219 aa9.73□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 MEIS2O14770 477 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 YEATS4O95619 227 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ALDH1A1P00352 501 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 MCM4P33991 863 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CLK2P49760 499 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 INF2Q27J81 1249 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 LETM2Q2VYF4 491 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 FCHSD1Q86WN1 690 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ANKRD35Q8N283 1001 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 FAM43AQ8N2R8 423 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 USP28Q96RU2 1077 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ANO3Q9BYT9 981 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 MROH8Q9H579 483 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TMEM260Q9NX78 707 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 BTBD7Q9P203 1132 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TCHHQ07283 1943 aa9.72□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 RASSF10A6NK89 507 aa9.71□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 NFIBO00712 420 aa9.71□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 MCM7P33993 719 aa9.71□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ZNF76P36508 570 aa9.71□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ME1P48163 572 aa9.71□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 HSD17B4P51659 736 aa9.71□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 USP11P51784 963 aa9.71□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ERVK-9P63128 1117 aa9.71□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85 ms