RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561868.1

SPNS1-205, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 441 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-205ENST00000561868 FEM1BQ9UK73 627 aa18.41■□□□□ 0.54
SPNS1-205ENST00000561868 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa18.41■□□□□ 0.54
SPNS1-205ENST00000561868 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
SPNS1-205ENST00000561868 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
SPNS1-205ENST00000561868 PLA2G6O60733 806 aa18.4■□□□□ 0.54
SPNS1-205ENST00000561868 KDM4AO75164 1064 aa18.4■□□□□ 0.54
SPNS1-205ENST00000561868 TOP1P11387 765 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
SPNS1-205ENST00000561868 FOSL2P15408 326 aa18.4■□□□□ 0.54
SPNS1-205ENST00000561868 CCDC178Q5BJE1 867 aa18.4■□□□□ 0.54
SPNS1-205ENST00000561868 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa18.4■□□□□ 0.54
SPNS1-205ENST00000561868 CHST13Q8NET6 341 aa18.4■□□□□ 0.54
SPNS1-205ENST00000561868 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
SPNS1-205ENST00000561868 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
SPNS1-205ENST00000561868 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
SPNS1-205ENST00000561868 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa18.4■□□□□ 0.54
SPNS1-205ENST00000561868 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
SPNS1-205ENST00000561868 MCM3APO60318 1980 aa18.4■□□□□ 0.54
SPNS1-205ENST00000561868 LAMA4Q16363 1823 aa18.39■□□□□ 0.54
SPNS1-205ENST00000561868 B4E1Z4 1266 aa18.39■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 TIMP1P01033 207 aa18.39■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 BMP3P12645 472 aa18.39■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 FAAP100Q0VG06 881 aa18.39■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 NECTIN1Q15223 517 aa18.39■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 KCNA10Q16322 511 aa18.39■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 MYLIPQ8WY64 445 aa18.39■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 TAF6LQ9Y6J9 622 aa18.39■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 ITGB8P26012 769 aa18.38■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP18.38■□□□□ 0.537e-11■■■■□ 24.1
SPNS1-205ENST00000561868 ACVR2BQ13705 512 aa18.38■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 CASC1Q6TDU7 716 aa18.38■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 IQCA1Q86XH1 822 aa18.38■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 ANKRD35Q8N283 1001 aa18.38■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa18.38■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 E7EWF7 191 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 TLR3O15455 904 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 MCCP23508 829 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 SLC1A4P43007 532 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 CPXCR1Q8N123 301 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 SNHG28P0DPA3 235 aa18.36■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 DNAJB2P25686 324 aa18.36■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 GJA9P57773 515 aa18.36■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 MFSD5Q6N075 450 aa18.36■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 STOX1Q6ZVD7 989 aa18.36■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 DCAF4Q8WV16 495 aa18.36■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 KIFC2Q96AC6 838 aa18.36■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa18.36■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa18.36■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 ANO2Q9NQ90 1003 aa18.36■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 TBX21Q9UL17 535 aa18.36■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 RIPK3Q9Y572 518 aa18.36■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 TMEM232C9JQI7 657 aa18.35■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 CDK7P50613 346 aa18.35■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 EPHB4P54760 987 aa18.35■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 TRDNQ13061 729 aa18.35■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 SEC23AQ15436 765 aa18.35■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 BTNL9Q6UXG8 535 aa18.35■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 CYB5R4Q7L1T6 521 aa18.35■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 FAM160B2Q86V87 743 aa18.35■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 TMEM199Q8N511 208 aa18.35■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 CHURC1Q8WUH1 139 aa18.35■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 VTI1AQ96AJ9 217 aa18.35■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 ARVCFO00192 962 aa18.34■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 SLC27A2O14975 620 aa18.34■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 ASGR1P07306 291 aa18.34■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 PDHBP11177 359 aa18.34■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 SLC4A3P48751 1232 aa18.34■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 STAT2P52630 851 aa18.34■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 NKX3-2P78367 333 aa18.34■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 TKFCQ3LXA3 575 aa18.34■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 CCDC144BQ3MJ40 725 aa18.34■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 TSGA10IPQ3SY00 556 aa18.34■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 GNASQ5JWF2 1037 aa18.34■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 CREB3L3Q68CJ9 461 aa18.34■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 ARMCX2Q7L311 632 aa18.34■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 NCOA7Q8NI08 942 aa18.34■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 ACAD9Q9H845 621 aa18.34■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 MYO9BQ13459 2157 aa18.34■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 TNKSO95271 1327 aa18.33■□□□□ 0.53
SPNS1-205ENST00000561868 ASB14A6NK59 587 aa18.33■□□□□ 0.52
SPNS1-205ENST00000561868 CABYRO75952 493 aa18.33■□□□□ 0.52
SPNS1-205ENST00000561868 KCTD1Q719H9 257 aa18.33■□□□□ 0.52
SPNS1-205ENST00000561868 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
SPNS1-205ENST00000561868 TIFAQ96CG3 184 aa18.33■□□□□ 0.52
SPNS1-205ENST00000561868 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
SPNS1-205ENST00000561868 RASGRP2Q7LDG7 609 aa18.32■□□□□ 0.52
SPNS1-205ENST00000561868 PNMA1Q8ND90 353 aa18.32■□□□□ 0.52
SPNS1-205ENST00000561868 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
SPNS1-205ENST00000561868 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms