RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 OR52Z1P0C646 297 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 ATP1A3P13637 1013 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 ICA1Q05084 483 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 LRMPQ12912 555 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 SEPT2Q15019 361 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 ABCB5Q2M3G0 1257 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 LETM2Q2VYF4 491 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 KCTD1Q719H9 257 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 LRRC8AQ8IWT6 810 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 AK8Q96MA6 479 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 RIC8AQ9NPQ8 531 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 DISC1Q9NRI5 854 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 TMOD2Q9NZR1 351 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 YY1P25490 414 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 CASP1P29466 404 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 SLC16A2P36021 539 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 GSDMDP57764 484 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 CSRNP1Q96S65 589 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 MTRQ99707 1265 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 FANCLQ9NW38 375 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM260Q9NX78 707 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 USP17L10C9JJH3 530 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 CBFA2T2O43439 604 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 GDF11O95390 407 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 CDC25AP30304 524 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 SLC1A4P43007 532 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 CLK2P49760 499 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 KARSQ15046 597 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 SLFN13Q68D06 897 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 OGFOD1Q8N543 542 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 ATAD5Q96QE3 1844 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF18P17022 549 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 RPS12P25398 132 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 UBA7P41226 1012 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 STAT6P42226 847 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 UBASH3AP57075 661 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 DLGAP5Q15398 846 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 SPDYE2Q495Y8 402 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 NAALADL2Q58DX5 795 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 MTMR14Q8NCE2 650 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 AGBL3Q8NEM8 1001 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 FAM151AQ8WW52 585 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 STAMQ92783 540 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 CUL5Q93034 780 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 MED15Q96RN5 788 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 PP2D1A8MPX8 630 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 F5H6K3 240 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 EDIL3O43854 480 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 SERPINC1P01008 464 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 MYL1P05976 194 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 KLRC3Q07444 240 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 CUL4BQ13620 913 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 GMCL1Q96IK5 515 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 MTMR9Q96QG7 549 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 GLT8D2Q9H1C3 349 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 SCN4AP35499 1836 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 CNTNAP1P78357 1384 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 TCP10L2B9ZVM9 353 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 GH2P01242 217 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 CD44P16070 742 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 TERF1P54274 439 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 JAG1P78504 1218 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 ARID5BQ14865 1188 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 QRICH1Q2TAL8 776 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 FKBP1CQ5VVH2 108 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 RRAGBQ5VZM2 374 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 TMC6Q7Z403 805 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 IGSF22Q8N9C0 903 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 DPF2Q92785 391 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 BLZF1Q9H2G9 400 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 CUEDC2Q9H467 287 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 MAGEF1Q9HAY2 307 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 RMND1Q9NWS8 449 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 GPRC5DQ9NZD1 345 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 SMCHD1A6NHR9 2005 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 CLRN2A0PK11 232 aa9.25□□□□□ -0.93
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