RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-204ENST00000469376 LTBP1Q14766 1721 aa29.09■■■□□ 2.25
OPN3-204ENST00000469376 COBLO75128 1261 aa29.08■■■□□ 2.25
OPN3-204ENST00000469376 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
OPN3-204ENST00000469376 GSTO1P78417 241 aa29.08■■■□□ 2.25
OPN3-204ENST00000469376 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa29.08■■■□□ 2.25
OPN3-204ENST00000469376 THAP9Q9H5L6 903 aa29.08■■■□□ 2.25
OPN3-204ENST00000469376 MAGEF1Q9HAY2 307 aa29.08■■■□□ 2.25
OPN3-204ENST00000469376 PCDHA6Q9UN73 950 aa29.08■■■□□ 2.25
OPN3-204ENST00000469376 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa29.08■■■□□ 2.25
OPN3-204ENST00000469376 A0A1W2PQC6 194 aa29.08■■■□□ 2.25
OPN3-204ENST00000469376 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
OPN3-204ENST00000469376 UBXN1Q04323 297 aa29.08■■■□□ 2.25
OPN3-204ENST00000469376 STAG2Q8N3U4 1231 aa29.08■■■□□ 2.25
OPN3-204ENST00000469376 ACRBPQ8NEB7 543 aa29.08■■■□□ 2.25
OPN3-204ENST00000469376 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
OPN3-204ENST00000469376 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
OPN3-204ENST00000469376 CUEDC2Q9H467 287 aa29.08■■■□□ 2.25
OPN3-204ENST00000469376 CD2APQ9Y5K6 639 aa29.08■■■□□ 2.25
OPN3-204ENST00000469376 A0A0U1RQJ8 604 aa29.07■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 CCDC66A2RUB6 948 aa29.07■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 KRT9P35527 623 aa29.07■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 NAALADL2Q58DX5 795 aa29.07■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 SLC35F6Q8N357 371 aa29.07■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 ATRIPQ8WXE1 791 aa29.07■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 MKNK2Q9HBH9 465 aa29.07■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 SPON1Q9HCB6 807 aa29.07■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 BARHL2Q9NY43 387 aa29.07■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 LGALS16A8MUM7 142 aa29.06■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 SASH3O75995 380 aa29.06■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 LDHBP07195 334 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa29.06■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 ZNF804AQ7Z570 1209 aa29.06■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 RHOBTB3O94955 611 aa29.06■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 UBA7P41226 1012 aa29.06■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 IRF2BP1Q8IU81 584 aa29.06■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 MSANTD4Q8NCY6 345 aa29.06■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 KBTBD4Q9NVX7 518 aa29.06■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 BAG3O95817 575 aa29.05■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 ARHGAP25P42331 645 aa29.05■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa29.05■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 TYW1BQ6NUM6 668 aa29.05■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 MB21D1Q8N884 522 aa29.05■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 RASSF8Q8NHQ8 419 aa29.05■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 RASGRP4Q8TDF6 673 aa29.05■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 MYH8P13535 1937 aa29.05■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 STXBP3O00186 592 aa29.04■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 PSMA7O14818 248 aa29.04■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 TSPY3P0CV98 308 aa29.04■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 TSPY8P0CW00 308 aa29.04■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 CDC25AP30304 524 aa29.04■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 PPP4CP60510 307 aa29.04■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 FUT8Q9BYC5 575 aa29.04■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 PIM2Q9P1W9 311 aa29.04■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 NAV1Q8NEY1 1877 aa29.04■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 C21orf2O43822 256 aa29.04■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 KLRC4O43908 158 aa29.04■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 AK8Q96MA6 479 aa29.04■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 TMEM60Q9H2L4 133 aa29.04■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 RAB21Q9UL25 225 aa29.04■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 CYP2C19P33261 490 aa29.03■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 LONRF2Q1L5Z9 754 aa29.03■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 CERS3Q8IU89 383 aa29.03■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 OR8K1Q8NGG5 319 aa29.03■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 DYNLL2Q96FJ2 89 aa29.03■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 INF2Q27J81 1249 aa29.02■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa29.02■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 DNAJC7Q99615 494 aa29.02■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 ZNF287Q9HBT7 754 aa29.02■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa29.02■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 LDHCP07864 332 aa29.02■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 ZNF507Q8TCN5 953 aa29.02■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa29.02■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
OPN3-204ENST00000469376 RIMBP2O15034 1052 aa29.01■■■□□ 2.23
OPN3-204ENST00000469376 TUBBP07437 444 aa29.01■■■□□ 2.23
OPN3-204ENST00000469376 PPP1R2P41236 205 aa29.01■■■□□ 2.23
OPN3-204ENST00000469376 SLC35G1Q2M3R5 365 aa29.01■■■□□ 2.23
OPN3-204ENST00000469376 SPZ1Q9BXG8 430 aa29.01■■■□□ 2.23
OPN3-204ENST00000469376 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
OPN3-204ENST00000469376 CAPN11Q9UMQ6 739 aa29.01■■■□□ 2.23
OPN3-204ENST00000469376 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
OPN3-204ENST00000469376 USP17L3A6NCW0 530 aa29.01■■■□□ 2.23
OPN3-204ENST00000469376 USP17L4A6NCW7 530 aa29.01■■■□□ 2.23
OPN3-204ENST00000469376 CYTH3O43739 400 aa29.01■■■□□ 2.23
OPN3-204ENST00000469376 ERLIN1O75477 346 aa29.01■■■□□ 2.23
OPN3-204ENST00000469376 NDUFA10O95299 355 aa29.01■■■□□ 2.23
OPN3-204ENST00000469376 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
OPN3-204ENST00000469376 USP17L1Q7RTZ2 530 aa29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.2 ms