RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298919.7

PDZRN4-201, Transcript of PDZ domain containing ring finger 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PDZRN4, Length 3,411 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4-201ENST00000298919 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 CALML3P27482 149 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 GNG11P61952 73 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 PAK1Q13153 545 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 KCNJ12Q14500 433 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 TTBK2Q6IQ55 1244 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 KCNK18Q7Z418 384 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 KIAA0895Q8NCT3 520 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 COA7Q96BR5 231 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 MTMR9Q96QG7 549 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 CCSER1Q9C0I3 900 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 DNAJC18Q9H819 358 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 ABHD10Q9NUJ1 306 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 GGA1Q9UJY5 639 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 AFF2P51816 1311 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 SMCO2A6NFE2 343 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 RIMBP2O15034 1052 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 RHOBTB3O94955 611 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 BAG3O95817 575 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 SNHG28P0DPA3 235 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 STAT6P42226 847 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 GTF2IP78347 998 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 DMTNQ08495 405 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 DTHD1Q6ZMT9 781 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 PNMA5Q96PV4 448 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 FEZ1Q99689 392 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 TTYH3Q9C0H2 523 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 MTMR4Q9NYA4 1195 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 TTC26A0AVF1 554 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 ATP2B4P23634 1241 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 TECP42680 631 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 PLA2G4AP47712 749 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 GSTO1P78417 241 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 GRB10Q13322 594 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 LETM2Q2VYF4 491 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 MIIPQ5JXC2 388 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 ANKRD40Q6AI12 368 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 TBCKQ8TEA7 893 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 PLIN4Q96Q06 1357 aa7.29□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa7.29□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 RCCD1A6NED2 376 aa7.29□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 F8W031 263 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 TDP2O95551 362 aa7.29□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 SHMT1P34896 483 aa7.29□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 NFIAQ12857 509 aa7.29□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 PICALMQ13492 652 aa7.29□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa7.29□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 TRIM9Q9C026 710 aa7.29□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 SEMA6BQ9H3T3 888 aa7.29□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 ZSCAN12O43309 604 aa7.29□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 PRPHP41219 470 aa7.29□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 NAPAP54920 295 aa7.29□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 KCNB1Q14721 858 aa7.29□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa7.29□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 EPHB6O15197 1021 aa7.29□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 TRIM37O94972 964 aa7.29□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 CLK2P49760 499 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 SCNN1DP51172 638 aa7.29□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 DOK7Q18PE1 504 aa7.29□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa7.29□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 SIAH1Q8IUQ4 282 aa7.29□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 MB21D1Q8N884 522 aa7.29□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 KCNV2Q8TDN2 545 aa7.29□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 UIMC1Q96RL1 719 aa7.29□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa7.29□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 JMJD4Q9H9V9 463 aa7.29□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 N4BP3O15049 544 aa7.28□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 BBOX1O75936 387 aa7.28□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 OR52Z1P0C646 297 aa7.28□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 CASQ1P31415 396 aa7.28□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 SLC16A2P36021 539 aa7.28□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 HERVK_113P62684 666 aa7.28□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 JAG1P78504 1218 aa7.28□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 UBE2SQ16763 222 aa7.28□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 CABP7Q86V35 215 aa7.28□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 HAS1Q92839 578 aa7.28□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 UBXN6Q9BZV1 441 aa7.28□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa7.28□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 POTEMA6NI47 508 aa7.28□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 MYMKA6NI61 221 aa7.28□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 FAM196BA6NMK8 535 aa7.28□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 B4DLN1 442 aa7.28□□□□□ -1.24
PDZRN4-201ENST00000298919 TBC1D8O95759 1140 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms