RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 CRBNQ96SW2 442 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 TOMM22Q9NS69 142 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM39AQ9NV64 488 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 ADAMTS4O75173 837 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 KCNA10Q16322 511 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF697Q5TEC3 545 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 GLT1D1Q96MS3 346 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 PLA2G6O60733 806 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 ARMCX2Q7L311 632 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 TOX2Q96NM4 488 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 SZT2Q5T011 3432 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 ASB14A6NK59 587 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 DLL1O00548 723 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 ALAS1P13196 640 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 PDE1AP54750 535 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 KCTD1Q719H9 257 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 KLHDC9Q8NEP7 349 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 RNF146Q9NTX7 359 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 MTMR7Q9Y216 660 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 ALX1Q15699 326 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 GNASQ5JWF2 1037 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 C9orf50Q5SZB4 431 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC174Q6PII3 467 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 TICAM2Q86XR7 235 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 INCENPQ9NQS7 918 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 ELP1O95163 1332 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 MROH7Q68CQ1 1323 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.76■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 KIAA0355O15063 1070 aa22.76■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 CNTN2Q02246 1040 aa22.76■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC96Q2M329 555 aa22.76■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa22.76■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM161BQ96MY7 647 aa22.76■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 ORC4O43929 436 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 NMT2O60551 498 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 ASGR1P07306 291 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 CST5P28325 142 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 GJA9P57773 515 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 FPGSQ05932 587 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 AAMPQ13685 434 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 VPS53Q5VIR6 699 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 DCAF4Q8WV16 495 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 TNFAIP2Q03169 654 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 FAAP100Q0VG06 881 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 RILPL2Q969X0 211 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF536O15090 1300 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 FOXP2O15409 715 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 FGAP02671 866 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 FGD4Q96M96 766 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 LTBP2Q14767 1821 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 MYADML2A6NDP7 307 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 TLR3O15455 904 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 ZEB2O60315 1214 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 FGRP09769 529 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 ITGB8P26012 769 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 SNAP25P60880 206 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 NSMFQ6X4W1 530 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM227BQ96M60 508 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 SOWAHBA6NEL2 793 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 TIMP1P01033 207 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 LNPKQ9C0E8 428 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-220ENST00000511663 ARVCFO00192 962 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 ICAM1P05362 532 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 GUCD1Q96NT3 240 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.7■■□□□ 1.22
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