RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-204ENST00000469376 PCDHA4Q9UN74 947 aa29.19■■■□□ 2.26
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OPN3-204ENST00000469376 NELFBQ8WX92 580 aa29.18■■■□□ 2.26
OPN3-204ENST00000469376 PRDX5P30044 214 aa29.17■■■□□ 2.26
OPN3-204ENST00000469376 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP29.17■■■□□ 2.263e-7■■□□□ 12.3
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OPN3-204ENST00000469376 GDAQ9Y2T3 454 aa29.1■■■□□ 2.25
OPN3-204ENST00000469376 PRPHP41219 470 aa29.09■■■□□ 2.25
OPN3-204ENST00000469376 STIM1Q13586 685 aa29.09■■■□□ 2.25
OPN3-204ENST00000469376 WDR66Q8TBY9 1149 aa29.09■■■□□ 2.25
OPN3-204ENST00000469376 C7orf43Q8WVR3 580 aa29.09■■■□□ 2.25
OPN3-204ENST00000469376 LZTS2Q9BRK4 669 aa29.09■■■□□ 2.25
OPN3-204ENST00000469376 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
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