RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420808.2

NISCH-202, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NISCH, Length 2,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-202ENST00000420808 FLT1P17948 1338 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 LRRC10BA6NIK2 292 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 USP17L5A8MUK1 530 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 EFCAB8A8MWE9 144 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 SASH3O75995 380 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 PLCG1P19174 1290 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 PLA2G4AP47712 749 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 NAPAP54920 295 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 PPP4CP60510 307 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 UBXN1Q04323 297 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 SLF1Q9BQI6 1058 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 SH3GLB2Q9NR46 395 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 USP21Q9UK80 565 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP17.55■□□□□ 0.4
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NISCH-202ENST00000420808 F8W031 263 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
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NISCH-202ENST00000420808 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 SLC35F6Q8N357 371 aa17.55■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 UIMC1Q96RL1 719 aa17.55■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 MXD3Q9BW11 206 aa17.55■□□□□ 0.4
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NISCH-202ENST00000420808 KRT9P35527 623 aa17.54■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 TXLNAP40222 546 aa17.54■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 TECP42680 631 aa17.54■□□□□ 0.4
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NISCH-202ENST00000420808 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
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NISCH-202ENST00000420808 TTC26A0AVF1 554 aa17.54■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa17.54■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 PICALMQ13492 652 aa17.54■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 C16orf86Q6ZW13 317 aa17.54■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
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NISCH-202ENST00000420808 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa17.54■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
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NISCH-202ENST00000420808 POTEDQ86YR6 584 aa17.53■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 CNGA4Q8IV77 575 aa17.53■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 COA7Q96BR5 231 aa17.53■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 PARD6BQ9BYG5 372 aa17.53■□□□□ 0.4
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NISCH-202ENST00000420808 MYH1P12882 1939 aa17.53■□□□□ 0.4
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NISCH-202ENST00000420808 GSTO1P78417 241 aa17.52■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 CCDC178Q5BJE1 867 aa17.52■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 CABP7Q86V35 215 aa17.52■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 AMOTL1Q8IY63 956 aa17.52■□□□□ 0.4
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NISCH-202ENST00000420808 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 NHSQ6T4R5 1651 aa17.52■□□□□ 0.4
NISCH-202ENST00000420808 B4DLN1 442 aa17.52■□□□□ 0.39
NISCH-202ENST00000420808 GYS1P13807 737 aa17.52■□□□□ 0.39
NISCH-202ENST00000420808 CCDC148Q8NFR7 591 aa17.52■□□□□ 0.39
NISCH-202ENST00000420808 TRIM47Q96LD4 638 aa17.52■□□□□ 0.39
NISCH-202ENST00000420808 TBC1D8O95759 1140 aa17.51■□□□□ 0.39
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NISCH-202ENST00000420808 GNAQP50148 359 aa17.51■□□□□ 0.39
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NISCH-202ENST00000420808 RMND1Q9NWS8 449 aa17.51■□□□□ 0.39
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NISCH-202ENST00000420808 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
NISCH-202ENST00000420808 GGA1Q9UJY5 639 aa17.51■□□□□ 0.39
NISCH-202ENST00000420808 RHOBTB3O94955 611 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-202ENST00000420808 SERPINB2P05120 415 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-202ENST00000420808 TXKP42681 527 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-202ENST00000420808 GTF2IP78347 998 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-202ENST00000420808 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
NISCH-202ENST00000420808 ANKRD40Q6AI12 368 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-202ENST00000420808 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
NISCH-202ENST00000420808 WDR59Q6PJI9 974 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-202ENST00000420808 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
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