RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027809.7

Opn3-201, Transcript of Opsin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Opn3, Length 1,913 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3-201ENSMUST00000027809 Fgfr2P21803 821 aa25.03■■□□□ 1.6
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Slc7a1Q09143 622 aa25.02■■□□□ 1.6
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Scn10aQ6QIY3 1958 aa25.02■■□□□ 1.6
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Slc39a2G3X943 309 aa25.01■■□□□ 1.59
Opn3-201ENSMUST00000027809 Usp17ldG5E8G2 545 aa25.01■■□□□ 1.59
Opn3-201ENSMUST00000027809 Usp17lcG5E8I7 545 aa25.01■■□□□ 1.59
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Atp13a3Q5XF89 1219 aa25■■□□□ 1.59
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Fbln1Q08879 705 aa24.99■■□□□ 1.59
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Sox30Q8CGW4 782 aa24.98■■□□□ 1.59
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Zfp341Q6PGC9 846 aa24.98■■□□□ 1.59
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Megf6Q80V70 1572 aa24.98■■□□□ 1.59
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Cep128Q8BI22 1102 aa24.97■■□□□ 1.59
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Pagr1aQ99L02 253 aa24.97■■□□□ 1.59
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Opn3-201ENSMUST00000027809 CluhQ5SW19 1315 aa24.96■■□□□ 1.59
Opn3-201ENSMUST00000027809 Rsbn1lD3Z0K6 821 aa24.96■■□□□ 1.59
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Krt34Q9D646 392 aa24.96■■□□□ 1.59
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Opn3-201ENSMUST00000027809 Brms1Q99N20 246 aa24.95■■□□□ 1.58
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Opn3-201ENSMUST00000027809 LtbrP50284 415 aa24.94■■□□□ 1.58
Opn3-201ENSMUST00000027809 Rrp12Q6P5B0 1295 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
Opn3-201ENSMUST00000027809 Nap1l4Q78ZA7 375 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
Opn3-201ENSMUST00000027809 Sap130Q8BIH0 1057 aa24.94■■□□□ 1.58
Opn3-201ENSMUST00000027809 Snrnp35Q9D384 244 aa24.94■■□□□ 1.58
Opn3-201ENSMUST00000027809 Cd274Q9EP73 290 aa24.94■■□□□ 1.58
Opn3-201ENSMUST00000027809 CatspereP0DP43 985 aa24.94■■□□□ 1.58
Opn3-201ENSMUST00000027809 Traf1P39428 409 aa24.94■■□□□ 1.58
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