RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584377.5

CSNK1D-222, Transcript of casein kinase 1 delta, human

TSL 2

Gene CSNK1D, Length 2,891 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1D-222	ENST00000584377	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	MTR	Q99707	1265 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	USP21	Q9UK80	565 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	NEK11	Q8NG66	645 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	CDC25A	P30304	524 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	FANCG	O15287	622 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	NHS	Q6T4R5	1651 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	YY1AP1	Q9H869	796 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	CYTH3	O43739	400 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	PLA2G4A	P47712	749 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	PANX2	Q96RD6	677 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377		M0R2N6	131 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	COBL	O75128	1261 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	RASA1	P20936	1047 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	STAT6	P42226	847 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	BTD	P43251	543 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	GPSM2	P81274	684 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	TEX35	Q5T0J7	233 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	UFL1	O94874	794 aa		14.91	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	PBX1	P40424	430 aa		14.91	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	CLCN6	P51797	869 aa		14.91	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	RBL2	Q08999	1139 aa		14.91	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		14.91	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		14.91	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	RMND1	Q9NWS8	449 aa		14.91	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	BARHL2	Q9NY43	387 aa		14.91	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	SBF2	Q86WG5	1849 aa		14.91	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	PAK1	Q13153	545 aa		14.91	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	GALNT17	Q6IS24	598 aa		14.91	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		14.91	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		14.91	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	DESI2	Q9BSY9	194 aa		14.91	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	CD209	Q9NNX6	404 aa		14.91	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		14.91	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	STXBP3	O00186	592 aa		14.91	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		14.91	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	GNG11	P61952	73 aa		14.91	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	INF2	Q27J81	1249 aa		14.91	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		14.91	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		14.91	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	DISC1	Q9NRI5	854 aa		14.91	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		14.91	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		14.9	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		14.9	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		14.9	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	KLRF2	D3W0D1	207 aa		14.9	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	MTF1	Q14872	753 aa		14.9	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	TEX11	Q8IYF3	940 aa		14.9	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	MNS1	Q8NEH6	495 aa		14.9	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	NELFB	Q8WX92	580 aa		14.9	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	WDR24	Q96S15	920 aa		14.9	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	EYA3	Q99504	573 aa		14.9	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		14.9	□□□□□ -0.02
CSNK1D-222	ENST00000584377	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		14.89	□□□□□ -0.03
CSNK1D-222	ENST00000584377	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
CSNK1D-222	ENST00000584377	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		14.89	□□□□□ -0.03
CSNK1D-222	ENST00000584377	CASQ1	P31415	396 aa		14.89	□□□□□ -0.03

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