RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513056.5

FAM53C-211, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM53C, Length 923 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53C-211ENST00000513056 MYLIPQ8WY64 445 aa21.9■■□□□ 1.1
FAM53C-211ENST00000513056 SLF1Q9BQI6 1058 aa21.9■■□□□ 1.1
FAM53C-211ENST00000513056 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
FAM53C-211ENST00000513056 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
FAM53C-211ENST00000513056 MCM3APO60318 1980 aa21.89■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa21.89■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 ATP2A1O14983 1001 aa21.89■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 ACLYP53396 1101 aa21.89■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 EPHB4P54760 987 aa21.89■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 FPGSQ05932 587 aa21.89■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 SBK1Q52WX2 424 aa21.89■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 KLHDC9Q8NEP7 349 aa21.89■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 NYAP2Q9P242 653 aa21.89■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 FAM184BQ9ULE4 1060 aa21.89■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa21.88■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 FOSL2P15408 326 aa21.88■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 CST5P28325 142 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 FAAP100Q0VG06 881 aa21.88■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 GIMAP6Q6P9H5 292 aa21.88■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 STARD7Q9NQZ5 370 aa21.88■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 TMEM39AQ9NV64 488 aa21.88■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 DCDC2CA8MYV0 355 aa21.87■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 CHGBP05060 677 aa21.87■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 MROH7Q68CQ1 1323 aa21.86■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 RAD21O60216 631 aa21.86■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 RASA1P20936 1047 aa21.86■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 DDX11Q96FC9 970 aa21.86■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa21.86■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 COG6Q9Y2V7 657 aa21.86■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 MYO9BQ13459 2157 aa21.85■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 ELP1O95163 1332 aa21.85■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 F5H6K3 240 aa21.85■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 NDUFB10O96000 172 aa21.85■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 KLRC3Q07444 240 aa21.85■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 LRRCC1Q9C099 1032 aa21.85■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 BCL11AQ9H165 835 aa21.85■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 TBX21Q9UL17 535 aa21.85■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 TIMP1P01033 207 aa21.84■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 KCNA10Q16322 511 aa21.84■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 MKNK2Q9HBH9 465 aa21.84■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 RIPK3Q9Y572 518 aa21.84■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa21.83■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 GSG1L2A8MUP6 293 aa21.83■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 DNAJB2P25686 324 aa21.83■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 OAZ1P54368 228 aa21.83■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 GLT1D1Q96MS3 346 aa21.83■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa21.83■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa21.83■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 FBXO40Q9UH90 709 aa21.83■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
FAM53C-211ENST00000513056 ZBED4O75132 1171 aa21.82■■□□□ 1.08
FAM53C-211ENST00000513056 CDK7P50613 346 aa21.82■■□□□ 1.08
FAM53C-211ENST00000513056 ACVR2BQ13705 512 aa21.82■■□□□ 1.08
FAM53C-211ENST00000513056 MFSD5Q6N075 450 aa21.82■■□□□ 1.08
FAM53C-211ENST00000513056 CCDC174Q6PII3 467 aa21.82■■□□□ 1.08
FAM53C-211ENST00000513056 CHST13Q8NET6 341 aa21.82■■□□□ 1.08
FAM53C-211ENST00000513056 MKL1Q969V6 931 aa21.82■■□□□ 1.08
FAM53C-211ENST00000513056 SPC25Q9HBM1 224 aa21.82■■□□□ 1.08
FAM53C-211ENST00000513056 ZNF287Q9HBT7 754 aa21.82■■□□□ 1.08
FAM53C-211ENST00000513056 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
FAM53C-211ENST00000513056 FEM1BQ9UK73 627 aa21.82■■□□□ 1.08
FAM53C-211ENST00000513056 GJA9P57773 515 aa21.81■■□□□ 1.08
FAM53C-211ENST00000513056 NKX3-2P78367 333 aa21.81■■□□□ 1.08
FAM53C-211ENST00000513056 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP21.81■■□□□ 1.08
FAM53C-211ENST00000513056 KBTBD3Q8NAB2 608 aa21.81■■□□□ 1.08
FAM53C-211ENST00000513056 APPBP2Q92624 585 aa21.81■■□□□ 1.08
FAM53C-211ENST00000513056 ECHDC1Q9NTX5 307 aa21.81■■□□□ 1.08
FAM53C-211ENST00000513056 PLIN4Q96Q06 1357 aa21.8■■□□□ 1.08
FAM53C-211ENST00000513056 MYADML2A6NDP7 307 aa21.8■■□□□ 1.08
FAM53C-211ENST00000513056 FDX1P10109 184 aa21.8■■□□□ 1.08
FAM53C-211ENST00000513056 GNAT2P19087 354 aa21.8■■□□□ 1.08
FAM53C-211ENST00000513056 GRIN2CQ14957 1233 aa21.8■■□□□ 1.08
FAM53C-211ENST00000513056 CPXCR1Q8N123 301 aa21.8■■□□□ 1.08
FAM53C-211ENST00000513056 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa21.8■■□□□ 1.08
FAM53C-211ENST00000513056 FGD4Q96M96 766 aa21.8■■□□□ 1.08
FAM53C-211ENST00000513056 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.086e-6■■■■□ 21.1
FAM53C-211ENST00000513056 CLIP2Q9UDT6 1046 aa21.8■■□□□ 1.08
FAM53C-211ENST00000513056 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
FAM53C-211ENST00000513056 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
FAM53C-211ENST00000513056 ASGR1P07306 291 aa21.79■■□□□ 1.08
FAM53C-211ENST00000513056 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
FAM53C-211ENST00000513056 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
FAM53C-211ENST00000513056 CCDC144BQ3MJ40 725 aa21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.3 ms