RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	HOXC6	P09630	235 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	FGR	P09769	529 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	MCC	P23508	829 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	PDE4A	P27815	886 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIB2	Q92519	343 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	DPF3	Q92784	378 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	KAT14	Q9H8E8	782 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	PLA2G6	O60733	806 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	CHST13	Q8NET6	341 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	FOXP2	O15409	715 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	CHML	P26374	656 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	TKFC	Q3LXA3	575 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	DGKH	Q86XP1	1220 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	USP6NL	Q92738	828 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP2A1	O14983	1001 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	NMT2	O60551	498 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	KDM4A	O75164	1064 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	KCTD1	Q719H9	257 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	ACAD9	Q9H845	621 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	INCENP	Q9NQS7	918 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	PLXNB2	O15031	1838 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	RNF20	Q5VTR2	975 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	NBPF3	Q9H094	633 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A0G2JMZ2	1700 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246		B4E1Z4	1266 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	CCL14	Q16627	93 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC174	Q6PII3	467 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	NCOA7	Q8NI08	942 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246	PFAS	O15067	1338 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-231	ENST00000496246		B4DLN1	442 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-231	ENST00000496246	SGSM2	O43147	1006 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-231	ENST00000496246	EVI5	O60447	810 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-231	ENST00000496246	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-231	ENST00000496246	ALAS1	P13196	640 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-231	ENST00000496246	CYP2C19	P33261	490 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-231	ENST00000496246	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-231	ENST00000496246	TRAF1	Q13077	416 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-231	ENST00000496246	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-231	ENST00000496246	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-231	ENST00000496246	PNMA1	Q8ND90	353 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-231	ENST00000496246	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-231	ENST00000496246	MAML3	Q96JK9	1138 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-231	ENST00000496246	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-231	ENST00000496246	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-231	ENST00000496246	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-231	ENST00000496246	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-231	ENST00000496246	RNF146	Q9NTX7	359 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-231	ENST00000496246	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-231	ENST00000496246	NEDD4	P46934	1319 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-231	ENST00000496246	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-231	ENST00000496246	KBTBD13	C9JR72	458 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-231	ENST00000496246	POTEB2	H3BUK9	544 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-231	ENST00000496246	TNKS	O95271	1327 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-231	ENST00000496246	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-231	ENST00000496246	PGK2	P07205	417 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-231	ENST00000496246	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-231	ENST00000496246	NOV	P48745	357 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIM32	Q13049	653 aa		13.26	□□□□□ -0.29

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