RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 RTL9Q8NET4 1388 aa20.63■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 SYF2O95926 243 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 CYP26C1Q6V0L0 522 aa20.63■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 BICDL1Q6ZP65 573 aa20.63■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 MYH2Q9UKX2 1941 aa20.63■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa20.63■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 CYP7A1P22680 504 aa20.63■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 NPY5RQ15761 445 aa20.63■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 RRAGBQ5VZM2 374 aa20.63■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC148Q8NFR7 591 aa20.63■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 TAB2Q9NYJ8 693 aa20.63■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 TTC38Q5R3I4 469 aa20.62■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 C3orf67Q6ZVT6 689 aa20.62■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 AMIGO3Q86WK7 504 aa20.62■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 CERKQ8TCT0 537 aa20.62■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 AFAP1L1Q8TED9 768 aa20.62■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 MTRQ99707 1265 aa20.62■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 SLF1Q9BQI6 1058 aa20.62■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 ABCF2Q9UG63 623 aa20.62■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 COL4A1P02462 1669 aa20.62■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 PPFIA4O75335 1185 aa20.61■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 USP14P54578 494 aa20.61■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 E2F4Q16254 413 aa20.61■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 PPM1EQ8WY54 764 aa20.61■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa20.61■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa20.61■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 TNFRSF25Q93038 417 aa20.61■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKRD65E5RJM6 399 aa20.6■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 COPB1P53618 953 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 ERFEQ4G0M1 354 aa20.6■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa20.6■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 HPCAL4Q9UM19 191 aa20.6■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa20.6■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 BTAF1O14981 1849 aa20.6■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 AFF2P51816 1311 aa20.6■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRC10BA6NIK2 292 aa20.6■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 PPP2R5BQ15173 497 aa20.6■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 CATIPQ7Z7H3 387 aa20.6■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 BMP15O95972 392 aa20.59■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT9P35527 623 aa20.59■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 TROAPQ12815 778 aa20.59■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 TCP11X2Q5H9J9 407 aa20.59■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 PDXDC2PQ6P474 469 aa20.59■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 CHP1Q99653 195 aa20.59■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.59■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM10Q9UDY6 481 aa20.59■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF652Q9Y2D9 606 aa20.59■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNJ18B7U540 433 aa20.59■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 PAK1Q13153 545 aa20.59■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNJ12Q14500 433 aa20.59■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 IL17AQ16552 155 aa20.59■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC152Q4G0S7 254 aa20.59■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 TBC1D9BQ66K14 1250 aa20.59■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 NELFBQ8WX92 580 aa20.59■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 RWDD2AQ9UIY3 292 aa20.59■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 ANAPC4Q9UJX5 808 aa20.59■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 JRKLQ9Y4A0 524 aa20.59■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa20.59■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa20.58■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 ADAMTS3O15072 1205 aa20.58■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa20.58■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 MCM3P25205 808 aa20.58■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 MCM7P33993 719 aa20.58■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM14Q14142 442 aa20.58■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 MAP9Q49MG5 647 aa20.58■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 CLEC4GQ6UXB4 293 aa20.58■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 YY1AP1Q9H869 796 aa20.58■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 GUCA1BQ9UMX6 200 aa20.58■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 GDAQ9Y2T3 454 aa20.58■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 GNPATO15228 680 aa20.57■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 HDAC6Q9UBN7 1215 aa20.57■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 PSMD14O00487 310 aa20.57■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 EVX2Q03828 476 aa20.57■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 UBXN1Q04323 297 aa20.57■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 MMS19Q96T76 1030 aa20.57■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF831Q5JPB2 1677 aa20.56■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 ENC1O14682 589 aa20.56■□□□□ 0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 NDUFA10O95299 355 aa20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 119.7 ms