RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547449.1

CS-209, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-209ENST00000547449 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 CABP5Q9NP86 173 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 BARHL2Q9NY43 387 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 PGAP2Q9UHJ9 254 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 PCDHA4Q9UN74 947 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 CEP131Q9UPN4 1083 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 CLRN2A0PK11 232 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 WNT10BO00744 389 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 CUTAO60888 179 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 NR1I2O75469 434 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 BMP15O95972 392 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 EEF2P13639 858 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 PRELPP51888 382 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 CNTNAP1P78357 1384 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 MAP3K11Q16584 847 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 FOCADQ5VW36 1801 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 BLIDQ8IZY5 108 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 FSIP1Q8NA03 581 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 CSRNP1Q96S65 589 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 FUCA2Q9BTY2 467 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 RBSNQ9H1K0 784 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP11.22□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 MYOZ2Q9NPC6 264 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 MYH1P12882 1939 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 TRIM75PA6NK02 468 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 STXBP3O00186 592 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 SLURP2P0DP57 97 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 PTPREP23469 700 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 TNNI2P48788 182 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 SEPT2Q15019 361 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 WWC2Q6AWC2 1192 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 NLGN2Q8NFZ4 835 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 DCAF4Q8WV16 495 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 ZMYND12Q9H0C1 365 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 TNMDQ9H2S6 317 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 MTMR7Q9Y216 660 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-209ENST00000547449 ESYT2A0FGR8 921 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 FAM196BA6NMK8 535 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 M0R2N6 131 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 KINO60870 393 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 UVSSAQ2YD98 709 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 NBPF9Q3BBW0 867 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 RESP18Q5W5W9 173 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 SLFN13Q68D06 897 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 TYW1BQ6NUM6 668 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 PIBF1Q8WXW3 757 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 MTMR8Q96EF0 704 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 TIGD1Q96MW7 591 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 PIGSQ96S52 555 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 UBA5Q9GZZ9 404 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 VEZTQ9HBM0 779 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 VAT1LQ9HCJ6 419 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 HPSEQ9Y251 543 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 A0A1B0GVL5 298 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 GH2P01242 217 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 CCDC192P0DO97 292 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 GNA11P29992 359 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 JAG1P78504 1218 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 ATP2B2Q01814 1243 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 RASSF7Q02833 373 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 ICA1Q05084 483 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 CAMK4Q16566 473 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 SHC4Q6S5L8 630 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 CLEC10AQ8IUN9 316 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP11.19□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 GMCL1Q96IK5 515 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 CPVLQ9H3G5 476 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 JMJD4Q9H9V9 463 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 C6orf50Q9HD87 102 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 GPCPD1Q9NPB8 672 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 GINM1Q9NU53 330 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 PCDHA6Q9UN73 950 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 PSME4Q14997 1843 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-209ENST00000547449 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms